Friday, March 10, 2017

DataCite services, Zenodo and MANY ORCID integration services (and impactstory)



DataCite services

Locate, identify, and cite research data with DataCite, a global provider of DOIs for research data.

https://www.datacite.org/
(less services than crossRef).

http://stephane-mottin.blogspot.fr/2017/01/datacite-inist-cern-metadata-schema.html

DOI handbook
http://www.doi.org/hb.html

In order to create new DataCite DOIs and assign them to your content, it is necessary to become a DataCite member or work with one of the current members.

Through the web interface or the API of the DataCite Metadata Store you will be able to submit a name, a metadata description following the DataCite Metadata Schema and at least one URL of the object to create a DOI. Once created, information about a DOI is available through our different services search, event data, OAI-PMH and others).

The DataCite Metadata Store is a service for data publishers to mint DOIs and register associated metadata. The service requires organisations to first register for an account with a DataCite member.
https://mds.datacite.org/

http://schema.datacite.org/

status of the services
http://status.datacite.org/

https://blog.datacite.org/

Services of DataCite profiles

DataCite Profiles integrates DataCite services from a user’s perspective and provides tools for personal use. In particular, it is a key piece of integration with ORCID, where researchers can connect their profiles and automatically update their ORCID record when any of their works contain a DOI.

https://profiles.datacite.org/
example
https://profiles.datacite.org/users/0000-0002-7088-4353
0000-0002-7088-4353 is my ORCID Id.

You can get

  • your ORCID Token 
  • your API Key
    (if you want to use the ORCID API).

In your profile, you can select how to connect:

You can also follow ORCID claims.
For example: "You have 5 successful claims, 0 notification claims, 0 queued claims and 0 failed claims"

You are also linked to Impactstory
Impactstory is an open-source website that helps researchers explore and share the the online impact of their research.
https://impactstory.org/u/0000-0002-7088-4353
0000-0002-7088-4353 is my ORCID id.

You must authorize impactstory.org to link with your ORCID.
You must also connect impactstory.org with your twitter.
In impactstory, Zenodo from ORCID are "datasets".

Zenodo and DataCite METADATA

If you use ZENODO, an Open Archive with DataCite DOI, DataCite services are interesting.

Zenodo gives a DataCite DOI and an export to a clean datacite METADATA (XML DataCite 3.1).

(see also my posts on this blog with the tag "zenodo")

Zenodo DataCite and Orcid

If you use ZENODO and your ORCID Id  then you have some services:

You must allow Zenodo to "Get your ORCID iD".

You must allow DataCite to  allow ORCID "Add works"
But only 5 METADATA are automatically sent to ORCID by DataCite.

  • Title, 
  • Year, 
  • Description (the full field of Zenodo), 
  • Contributor (the field 'creator' of Zenodo = authors),
  • DOI

You can add metadata in ORCID...
Change type 'Work category' and  'Work type'.
Then Source is changed from 'zenodo' to 'Stéphane MOTTIN'

In impactstory, Zenodo links (from ORCID) are considered as "datasets" with only 4 METADATA
  • Title, 
  • Year, 
  • Contributor (the field 'creator' of Zenodo = authors),
  • DOI

ORCID

You can see the list of ORCID "trusted organization"
at https://orcid.org/account
DataCite can 'add works'.


For other ORCID Search & link wizards:
http://support.orcid.org/knowledgebase/articles/188278-link-works-to-your-orcid-record-from-another-syste

for example
  • The Crossref Metadata Search integration allows you to search and add works by title or DOI. Once you have authorized the connection and are logged into ORCID, Crossref search results will also include a button to add works to your ORCID record.
    http://search.crossref.org/
  • The DataCite integration allows you to find your research datasets, images, and other works. Recommended for locating works other than articles and works that can be found by DOI.
  • The ISNI2ORCID integration allows you to link your ORCID and ISNI records and can be used to import books associated with your ISNI. Recommended for adding books.
    http://isni2orcid.labs.orcid-eu.org/
  • Use this tool to link your ResearcherID account and works from it to your ORCID record, and to send biographical and works information between ORCID and ResearcherID.
    http://wokinfo.com/researcherid/integration/
  • Use this wizard to import works associated with your Scopus Author ID; see Manage My [Scopus] Author Profile for more information. Recommended for adding multiple published articles to your ORCID record.
    https://www.elsevier.com/solutions/scopus/support/authorprofile

IFLA The International Federation of Library Associations and Institutions. A conference (2012) : Digitization and Preservation


The International Federation of Library Associations and Institutions (IFLA) is the leading international body representing the interests of library and information services and their users. It is the global voice of the library and information profession.

Founded in Edinburgh, Scotland, on 30 September 1927 at an international conference, we celebrated our 75th birthday at our conference in Glasgow, Scotland in 2002. We now have over 1300 Members in approximately 140 countries around the world. IFLA was registered in the Netherlands in 1971. The Royal Library, the national library of the Netherlands, in The Hague, generously provides the facilities for our headquarters.

Conference theme

"Newspaper Digitization and Preservation: New Prospects. Stakeholders, Practices, Users and Business Models", 2012


http://www.ifla.org/node/5932

cairn.info et le format fichiers XML structurés selon la DTD EruditArticle



Cairn.info est né de la volonté de quatre maisons d'édition (Belin, De Boeck, La Découverte et Erès) ayant en charge la publication et la diffusion de revues de sciences humaines et sociales, d’unir leurs efforts pour améliorer leur présence sur l’Internet, et de proposer à d’autres acteurs souhaitant développer une version électronique de leurs publications, les outils techniques et commerciaux développés à cet effet.
En février 2006, la Bibliothèque nationale de France s’est associée à ce projet, de façon à faciliter le développement d’une offre éditoriale francophone, sous forme numérique.
Cairn.info réunit, en outre, différents investisseurs institutionnels, notamment Gesval, la société ayant en charge la gestion des participations de l’Université de Liège.
En France, le Centre national du livre apporte son soutien à cette initiative.

En fait cairn.info est un aggrégateur.

http://www.cairn.info/a-propos.php
Droits intellectuels
Le contenu de ce site est protégé par le droit d’auteur. La copie, la traduction, la modification ou la diffusion de tout ou partie de celui-ci, sous quelque forme que ce soit, est interdite, sauf accord écrit préalable de CAIRN SA. Il en va notamment ainsi pour les textes, commentaires, ouvrages, illustrations, cartes et images présentés sur ce site, même si ceux-ci sont proposés ici gratuitement. Toute infraction à de tels droits intellectuels peut donner lieu à des poursuites civiles et pénales.

Pour les éditeurs

L’offre de services de Cairn.info
Cairn.info a pour objectif de faciliter la mise en ligne des publications de sciences humaines et sociales en aidant les maisons d’édition et autres structures éditoriales, à gérer cette période complexe où doivent coexister une version électronique et une version papier des mêmes publications. Pour tenir compte de la diversité des situations, notre offre est modulaire, quasiment « à la carte » :

  • Le cœur de l’offre est constitué d’un service d’hébergement et de distribution des publications de sciences humaines et sociales, sous forme numérique, via le portail www.cairn.info.
  • Mais ce service peut être complété par d’autres prestations, en fonction des besoins spécifiques de chaque publication.
  • Conversion ou rétroconversion – c’est-à-dire conversion rétrospective – des fichiers prépresse de façon à produire les fichiers XML, structurés selon la DTD EruditArticle, nécessaires à la présentation des articles sur le portail www.cairn.info.
  • Pour les revues, composition et mise en page, de façon à produire directement des fichiers utilisables à la fois pour la fabrication papier et électronique des revues.
  • Pour les revues, filtrage (par mot de passe) des accès éventuellement accordés par l’éditeur aux abonnés à la version papier du périodique.
  • Gestion des abonnements aux versions papier et numérique.
  • Diffusion enfin de ces publications sous forme numérique grâce notamment à un effort commercial ad hoc vis-à-vis des bibliothèques (insertion des publications dans des bouquets de publications et commercialisation de ces bouquets auprès des institutions et établissements de prêt).

Rétroconversion des fichiers

Les sociétés Isako (Paris) et Softwin (Bucarest), en charge de la rétroconversion des articles de revues.


liste des fonctionnalités des divers outils



ICS

Un seul outil pour convertir plusieurs formats en une seule fois.
Il offre de nombreuses fonctionnalités pour la définition et le paramétrage des tâches de conversion.

Infrastructure-independant : l’application ne nécessite pas d’infrastructure SGBD.

En entrée :
  • Papier après numérisation
  • PDF
En sortie :
  • PDF toutes versions, PDF/A,
  • XML  METS/ALTO
  • RTF, TXT,
  • XLS, HTML
Processus de conversion :
  • Pré-segmentation (voir outil PageView®)
  • Configuration des différents types d’exports souhaités en sortie
  • OCRisation,
  • Export des fichiers
Adaptive Document Recognition Technology :

Le mode adaptatif ADRT reconnaît la structure logique du document sur plusieurs pages : les en-têtes et pieds de pages, les paginations, les notes de bas de page, les polices et styles de caractères de l’ensemble du document d’origine sont conservés.

IsakoStudio Conversion System


IsakoStudio® Conversion System

Pour les éditeurs et les prestataires de services.
Convertir des ouvrages en E-books (EPUB, AZW, PDF) et en XML-Éditorial :
• Préparer des livres pour une édition électronique multi-formats.
• Produire un XML-Éditorial riche et précis de vos livres.

DCS


Chaîne de production industrielle utilisée pour la conversion d’ouvrages papier de type Livres et Périodiques à différents formats d’archivage et d’exploitation électroniques.

Ce système éprouvé, en production depuis juillet 2003, est destiné aux prestations d'indexation, de conversion OCR Haute-Qualité, et d'extraction des contenus selon un XML/Schema cible spécifique qui permet leur structuration au formats XML, ALTO, METS, PDF + texte caché, etc.
En Entrée :

Papier après numérisation 
En sortie :
XML éditeur pour agrégation et ePublishing
XML  METS/ALTO
PDF Image + Texte









Thursday, March 9, 2017

ZENODO export functions. Very good for JSON, DataCite XML and Marc21 XML (and DublinCore-OAI-PMH )


ZENODO

Zenodo puts only 4 bibliographic fields in metadata of each page!
Then the import with Zotero (with metadata translator) is quite bad...

example:
https://zenodo.org/record/376087

This article was published with an input of 20 zenodo fields
(+2 : zenodo automatically add DOI field and 'zenodo id' field).

access_right
"open"
communities
...
contributors
...
creators
...
description
" <b>  Sommaire de ce volume 18 de la Collection<br /> -- <i>Intégrations des savoirs et savoir faire</i> -- </b> <br /> <i> Matériaux et Joints d Etanchéité pour les hautes pressions.</i> <ul> <li>Préface / Dominique Leguillon</li><li>P. 13; Introduction générale / Patrick Boissinot, Patrick Langlois, Agílio A.H. Pádua</li><li>P. 17; Introduction au dimensionnement / Agílio A.H. Pádua; <br /> 1 Définition du problème; 2 Dimensionnement; 3 Obturateurs; 4 Conclusion</li><li>P. 27; Frettage et autofrettage / Patrick Langlois;<br /> 1 Considérations préliminaires au frettage; 2 Frettage d une enceinte bibloc; 3 Frettage d une enceinte multibloc; 4 Formulation de l autofrettage; 5 Modes de réalisation de l autofrettage; 6 Conclusion</li><li>P. 51; Méthodes d éléments finis en calcul de structures élastiques / Joël Frelat;<br /> 1 Introduction; 2 Rappel de la formule théorique; 3 Formulation variationnelle; 4 Formulation numérique; 5 Etapes d une mise en oeuvre pratique; 6 Conclusion Extension aux problèmes non linéaires</li><li>P. 61; Les matériaux sidérurgiques et les hautes pressions / Jean-Paul Dichtel; <br /> 1 Caractérisation mécanique des aciers; 2 Métallurgie des aciers et superalliages; 3 Commentaires : la Directive Européenne Appareils à Pression</li><li>P. 73; Les métaux non ferreux Alliage cuivre-béryllium et titane / Jean-Pierre Petitet; <br /> 1 Introduction; 2 Le cuivre-béryllium; 3 Le titane</li><li>P. 81; Les Carbures cémentés WC-Co / Emmanuel Pauty;<br />  1 Les procédés de fabrication; 2 Les propriétés des carbures cémentés; 3 Conclusions</li><li>P. 95; Choix et usinage des carbures de tungstène / Jacques Calzas;<br />  1 Choix des carbures de tungstène; 2 Usinage du carbure de tungstène</li><li>P. 107; Céramiques et matériaux pour l optique / Jean-Claude Chervin;<br />  1 Céramiques; 2 Matériaux pour l optique</li><li>P. 137; Types de joints et de montage / Roger Argoud et Jacques Roux;<br />  1 Introduction; 2 Généralités; 3 Joints à basse pression; 4 Joints cône sur cône; 5 Joints Bridgman Champignon; 6 Joints annulaires auto-serrés; 7 Joints coniques d Amagat; 8 Autres joints; 9 Conclusion</li><li>P. 157; Joints hautes pressions pour la compression de gros volumes solides / Sylvie Le Floch;<br />  1 Joints solides utilisés dans les différents types d enceintes hautes pressions; 2 Matières premières des joints; 3 Assemblages HP-HT</li><li>P. 169; Le matériel standard / Jean-Pierre Petitet;<br />  1 Tubes, conduites et raccords; 2 Les vannes; 3 Quelques types d enceintes commercialisées; 4 Les générateurs de pression; 5 Le matériel moins standard</li><li>P. 183; Assemblages haute pression / Gérard Hamel;<br />  1 Montage des raccords de pressions; 2 Montage de quelques passages électriques; 3 Les passages de thermocouple; 4 Les passages optiques, montage des fenêtres; 5 Montage des joints et des obturateurs sur une cellule haute pression</li><li>P. 193; Usinage / Jean-Pierre Michel;<br />  1 Introduction; 2 Les joints de faible épaisseur; 3 Les bagues anti-extrusion à 45; 4 Les joints à 45; 5 Les joints  double Bridgman ; 6 Les joints plats en élastomères; 7 Les joints en indium (étanchéité en hélium et azote liquide; 8 Joints métal-métal type Lens ring; 9 Les passages du courant; 10 Usinage de matériaux exotiques</li><li>P. 207; Les règles de sécurité / Patrick Boissinot;<br />  1 Dangers présentés par les appareils à pression; 2 Appareils à pression rencontrés dans les laboratoires et facteurs de risques; 3 Principes généraux de prévention et réglementation; 4 Moyens de protection; 5 Conclusion</li> </ul> "
imprint_isbn
"978-2918701040"
imprint_place
"Meudon, France"
imprint_publisher
"MRCT-CNRS"
keywords
...
license
"cc-by-nc-nd-4.0"
notes
" Licence CC-BY-NC-ND. Ce volume (cet ISBN) est une 3ième édition. Collection -- Intégrations des savoirs et savoir faire -- dirigée par Stéphane MOTTIN. Lien: http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour trouver cet ouvrage en bibliothèque). Ce PDF contient des metadata bibliographiques directement utilisables par exemple par Jabref (logiciel open source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en haut à gauche). Le sommaire détaillé avec structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des citations croisées internes à l ouvrage."
partof_pages
"51-60 "
partof_title
"Matériaux et joints d étanchéité pour les hautes pressions"
publication_date
"2011-04-15"
publication_type
"section"
references
...
related_identifiers
...
subjects
...
title
" Méthodes d’éléments finis en calcul de structures élastiques "
upload_type
"publication"

You can export in 7 formats:

  1. bibTeX
  2. CSL
  3. DataCite
  4. DublinCore
  5. JSON
  6. MarcXML
  7. Mendeley

bibTeX

@misc{frelat_joel_2011_376087,
  author       = {Frelat, Joël},
  title        = {{Méthodes d éléments finis en calcul de structures 
                   élastiques}},
  month        = apr,
  year         = 2011,
  note         = {{Licence CC-BY-NC-ND.  Ce volume (cet ISBN) est une 
                   3ième édition.   Collection -- Intégrations des
                   savoirs et savoir faire --         dirigée par
                   Stéphane MOTTIN.  Lien:
                   http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour
                   trouver cet ouvrage en bibliothèque).  Ce PDF
                   contient des metadata bibliographiques directement
                   utilisables par exemple par Jabref (logiciel open
                   source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et
                   balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en
                   haut à gauche). Le sommaire détaillé avec
                   structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs
                   résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des
                   citations croisées internes à l ouvrage.}},
  doi          = {10.5281/zenodo.376087},
  url          = {https://doi.org/10.5281/zenodo.376087}
}
only 7 fields!!!
very bad.

CSL Citation Style Language JSON Export

only 13 fields
abstract
"<p><strong>  Sommaire de ce volume 18 de la Collection<br> -- <em>Intégrations des savoirs et savoir faire</em>-- </strong><br> <em>Matériaux et Joints d Etanchéité pour les hautes pressions.</em></p> <ul> <li>Préface / Dominique Leguillon</li> <li>P. 13; Introduction générale / Patrick Boissinot, Patrick Langlois, Agílio A.H. Pádua</li> <li>P. 17; Introduction au dimensionnement / Agílio A.H. Pádua;<br> 1 Définition du problème; 2 Dimensionnement; 3 Obturateurs; 4 Conclusion</li> <li>P. 27; Frettage et autofrettage / Patrick Langlois;<br> 1 Considérations préliminaires au frettage; 2 Frettage d une enceinte bibloc; 3 Frettage d une enceinte multibloc; 4 Formulation de l autofrettage; 5 Modes de réalisation de l autofrettage; 6 Conclusion</li> <li>P. 51; Méthodes d éléments finis en calcul de structures élastiques / Joël Frelat;<br> 1 Introduction; 2 Rappel de la formule théorique; 3 Formulation variationnelle; 4 Formulation numérique; 5 Etapes d une mise en oeuvre pratique; 6 Conclusion Extension aux problèmes non linéaires</li> <li>P. 61; Les matériaux sidérurgiques et les hautes pressions / Jean-Paul Dichtel;<br> 1 Caractérisation mécanique des aciers; 2 Métallurgie des aciers et superalliages; 3 Commentaires : la Directive Européenne Appareils à Pression</li> <li>P. 73; Les métaux non ferreux Alliage cuivre-béryllium et titane / Jean-Pierre Petitet;<br> 1 Introduction; 2 Le cuivre-béryllium; 3 Le titane</li> <li>P. 81; Les Carbures cémentés WC-Co / Emmanuel Pauty;<br>   1 Les procédés de fabrication; 2 Les propriétés des carbures cémentés; 3 Conclusions</li> <li>P. 95; Choix et usinage des carbures de tungstène / Jacques Calzas;<br>   1 Choix des carbures de tungstène; 2 Usinage du carbure de tungstène</li> <li>P. 107; Céramiques et matériaux pour l optique / Jean-Claude Chervin;<br>   1 Céramiques; 2 Matériaux pour l optique</li> <li>P. 137; Types de joints et de montage / Roger Argoud et Jacques Roux;<br>   1 Introduction; 2 Généralités; 3 Joints à basse pression; 4 Joints cône sur cône; 5 Joints Bridgman Champignon; 6 Joints annulaires auto-serrés; 7 Joints coniques d Amagat; 8 Autres joints; 9 Conclusion</li> <li>P. 157; Joints hautes pressions pour la compression de gros volumes solides / Sylvie Le Floch;<br>   1 Joints solides utilisés dans les différents types d enceintes hautes pressions; 2 Matières premières des joints; 3 Assemblages HP-HT</li> <li>P. 169; Le matériel standard / Jean-Pierre Petitet;<br>   1 Tubes, conduites et raccords; 2 Les vannes; 3 Quelques types d enceintes commercialisées; 4 Les générateurs de pression; 5 Le matériel moins standard</li> <li>P. 183; Assemblages haute pression / Gérard Hamel;<br>   1 Montage des raccords de pressions; 2 Montage de quelques passages électriques; 3 Les passages de thermocouple; 4 Les passages optiques, montage des fenêtres; 5 Montage des joints et des obturateurs sur une cellule haute pression</li> <li>P. 193; Usinage / Jean-Pierre Michel;<br>   1 Introduction; 2 Les joints de faible épaisseur; 3 Les bagues anti-extrusion à 45; 4 Les joints à 45; 5 Les joints  double Bridgman ; 6 Les joints plats en élastomères; 7 Les joints en indium (étanchéité en hélium et azote liquide; 8 Joints métal-métal type Lens ring; 9 Les passages du courant; 10 Usinage de matériaux exotiques</li> <li>P. 207; Les règles de sécurité / Patrick Boissinot;<br>   1 Dangers présentés par les appareils à pression; 2 Appareils à pression rencontrés dans les laboratoires et facteurs de risques; 3 Principes généraux de prévention et réglementation; 4 Moyens de protection; 5 Conclusion</li> </ul>"
author
...
container_title
"Matériaux et joints d étanchéité pour les hautes pressions"
DOI
"10.5281/zenodo.376087"
id
"376087"
ISBN
"978-2918701040"
issued
...
note
"Licence CC-BY-NC-ND. Ce volume (cet ISBN) est une 3ième édition. Collection -- Intégrations des savoirs et savoir faire -- dirigée par Stéphane MOTTIN. Lien: http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour trouver cet ouvrage en bibliothèque). Ce PDF contient des metadata bibliographiques directement utilisables par exemple par Jabref (logiciel open source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en haut à gauche). Le sommaire détaillé avec structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des citations croisées internes à l ouvrage."
page
"51-60"
publisher
"MRCT-CNRS"
publisher_place
"Meudon, France"
title
"Méthodes d'éléments finis en calcul de structures élastiques"
type
"chapter"

no contributors
no licence (i put in the "note" field")...

DataCite XML Export

Zenodo gives a DataCite DOI then he must provide clean datacite METADATA to DataCite.

with XML tree view:



It's a clean XML DataCite 3.1
<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<resource 
xmlns:xsi= "http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
xmlns="http://datacite.org/schema/kernel-3" 
xsi:schemaLocation="http://datacite.org/schema/kernel-3 http://schema.datacite.org/meta/kernel-3/metadata.xsd">

<!--
 Revision history
     2010-08-26   Complete revision according to new common specification by the metadata work group after review. AJH, DTIC
2010-11-17 Revised to current state of kernel review, FZ, TIB 
2011-01-17 Complete revsion after community review. FZ, TIB
2011-03-17 Release of v2.1: added a namespace; mandatory properties got minLength; changes in the definitions of relationTypes
IsDocumentedBy/Documents and isCompiledBy/Compiles; changes type of property "Date" from xs:date to xs:string. FZ, TIB
2011-06-27 v2.2: namespace: kernel-2.2, additions to controlled lists "resourceType", "contributorType", "relatedIdentifierType", and "descriptionType". Removal of intermediate include-files.
     2013-05 v3.0: namespace: kernel-3.0; delete LastMetadataUpdate & MetadateVersionNumber; additions to controlled lists "contributorType", "dateType", "descriptionType", "relationType", "relatedIdentifierType" & "resourceType"; deletion of "StartDate" & "EndDate" from list "dateType" and "Film" from "resourceType";  allow arbitrary order of elements; allow optional wrapper elements to be empty; include xml:lang attribute for title, subject & description; include attribute schemeURI for nameIdentifier of creator, contributor & subject; added new attributes "relatedMetadataScheme", "schemeURI" & "schemeType" to relatedIdentifier; included new property "geoLocation" 
2014-08-20 v3.1: additions to controlled lists "relationType", contributorType" and "relatedIdentifierType"; introduction of new child element "affiliation" to "creator" and "contributor"
-->
only one field is empty:
no "CC-BY-NC-ND"

DublinCore (and OAI-PMH)

It's an XML with
http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"
<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<oai_dc:dc xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">

The field "notes " is empty.

It's for OAI-PMH Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting
http://www.openarchives.org/pmh/
The Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting (OAI-PMH) is a low-barrier mechanism for repository interoperability. Data Providers are repositories that expose structured metadata via OAI-PMH. Service Providers then make OAI-PMH service requests to harvest that metadata. OAI-PMH is a set of six verbs or services that are invoked within HTTP.

and DublinCore
http://dublincore.org/documents/2012/06/14/dcmi-terms/?v=elements


JSON

It's the same METADATA JSON uploaded

1/    with unicode encoding /u  (for example for "é" -> \u00e9)
2/    with a beautify/format transform of JSON
3-a/ with at the beginning
{"created": "2017-03-09T10:05:09.248886+00:00", 
  "doi": "10.5281/zenodo.376087", 
  "id": 376087, 
  "links": {
    "badge": "https://zenodo.org/badge/doi/10.5281/zenodo.376087.svg", 
    "doi": "https://doi.org/10.5281/zenodo.376087", 
    "html": "https://zenodo.org/record/376087"
  }, 

3-b/ and at the end
owners": [
    2222
  ], 
  "revision": 0, 

  "updated": "2017-03-09T10:05:09.248893+00:00"


MarcXML

very good (all fields) but it's an old marc format (good for librarians)
and XML format
<record xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim">

Mendeley

it's not an export but just a link to export
with only 3 METADATA {title, author and DOI} 
and a web service of automatic upload of PDFs.
If you have already the reference in Mendeley, it could be OK.
(I import my bibTeX references (JabRef) with Desktop Mendeley app and sync but problem, many fields 'notes' 'editor' = 0...).


Conclusion 

  • Very good for JSON, DataCite XML and Marc21 XML.
  • 'notes' lacks with the export DublinCore-OAI-PMH.
  • Put your BibTeX reference in your PDF.






Mendeley Elsevier 2.x , publication and data (DOI per dataset)

Mendeley is a free reference manager and academic social network that can help you organize your research, collaborate with others online, and discover the latest research.

see an open alternative: zotero
(see my posts with the tag "zotero").

https://en.wikipedia.org/wiki/Mendeley
Mendeley was purchased by the Elsevier publishing company in 2013. The sale led to debate on scientific networks and in the media interested in Open Access, and upset members of the scientific community who felt that the program's acquisition by publishing giant Elsevier, known for implementing restrictive publishing practices, the high prices of their journals, and publicly supporting the SOPA bill, was antithetical to the open sharing model of Mendeley. David Dobbs, in The New Yorker, suggested Elsevier's reasons for buying Mendeley could have been to acquire its user data and/or to "destroy or coopt an open-science icon that threatens its business model."

Web library

connect to https://www.mendeley.com
 and https://www.mendeley.com/library/

2 GB Personal Space
100 MB Shared Space


links with bibliometrics tools of Elsevier



data mendeley

Make your research data citable
DOIs and versioning following Force11 guidelines
Your published research data will include a Force11 compliant citation so that other researchers can effortlessly cite your research. We will also provide a unique DOI for each version of your dataset, so that your dataset's citation will always be valid.

Mendeley Data assigns a provisional DOI to draft datasets. The issuing of a permanent DOI for Mendeley Data submitted datasets is carried out by the British Library via DataCite. It is used to make a document/reference uniquely identifiable from any other document/reference when your article is published and made available electronically. The DOI for a document remains fixed over the lifetime of the document.

https://data.mendeley.com/

with many choices of licenses.

mendeley extension

chrome firefox safari IE

chrome

https://chrome.google.com/webstore/detail/mendeley-importer/dagcmkpagjlhakfdhnbomgmjdpkdklff?hl=en
Save references to Mendeley from Chrome easily! Mendeley is a free, easy-to-use tool to help you collect, organise, cite and share…
Save references to Mendeley from Chrome easily!

Mendeley is a free, easy-to-use tool to help you collect, organise, cite and share your research sources.

With the Mendeley Web Importer extension, you are able to easily save references and PDF files into your personal library with a single click. You’ll need to have a Mendeley account already set up in order to use the Mendeley Web Importer. Creating a Mendeley account takes just a couple of minutes.

To use the new Mendeley Web Importer for Chrome, you just need to be viewing an article or a list of references in the browser. This can mean that you’re looking at an actual PDF file, an article entry in an online catalog, or even a list of search results. The Mendeley Web Importer extension will scan the page for metadata, and provide you with a list of the results it finds.

Click on the red Mendeley button next to the address bar in Chrome to import the content you are currently viewing. Depending on the number of results the Importer finds, you’ll be provided with a list of different items, or specific details of a single item. You can then review the details, and even make manual corrections within the Importer itself, before choosing to add the references to your personal Mendeley library.

Version: 2.0.0
Updated: March 2, 2017

Desktop Application 

Use the Desktop Application to save your documents offline and cite your references in Microsoft Word or LibreOffice
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/

version 1.17
download Mac OSX.dmg = 92Mo  ->300Mo

Support

What is the mapping between .bib files and Mendeley?

Finding a research data article repository archive


Whether you're looking for data to reuse or integrate with your research, or trying to find somewhere to deposit your own data, a relevant data repository (also known as an archive or data centre) is a good place to start.

https://www.imperial.ac.uk/research-and-innovation/support-for-staff/scholarly-communication/research-data-management/archival-and-preservation/finding-a-research-data-repository--archive/

Discipline-specific repositories

The best place to start is a repository that focuses specifically on the types of data you work with. There are thousands of these available, but you can easily browse by subject area in the Registry of Research Data Repositories (re3data) to find something suitable.

General-purpose repositories

If there isn't a suitable specialised repository, we recommend trying one or more of the following more general options:

Zenodo 

example:
https://zenodo.org/record/375921
An open access data, software and publication repository for researchers who want to share multidisciplinary research results not available in other repositories. It was developed by and is hosted at CERN, but is suitable for all types of research data. It is free to use and has guaranteed funding from the EU for the foreseeable future.

dryad

http://datadryad.org/
only datasets
Dryad is built upon the open-source DSpace repository software. All customizations not available within the main DSpace distribution are available from the Dryad code repository under an open source (new BSD) license.
Dryad supports multiple ways of receiving article or manuscript metadata from publishers. The simplest method involves reading email notifications, but we are also implementing a REST API for those desiring greater control over the data deposition process.
Digital Object Identifers provided by DataCite through EZID

datahub Open Knowledge Foundation

https://datahub.io/
CKAN is a tool for managing and publishing collections of data. It is used by national and local governments, research institutions, and other organisations which collect a lot of data. With its powerful search and faceting, users can browse and find the data they need, and preview it using maps, graphs and tables - whether they are developers, journalists, researchers, NGOs, citizens or your own colleagues.

CKAN is free, open-source software, which has been developed by the Open Knowledge Foundation since 2006 and used by government and organisations around the world. Version 2.0 was released in May 2013.


Wednesday, March 8, 2017

process for adding a journal/article to PubMed Central (PMC) and JATS (Journal Article Tag Suite)

PMC

PMC is a free archive of biomedical and life sciences journal literature at the U.S. National Institutes of Health's National Library of Medicine (NIH/NLM). It is a repository for journal literature deposited by participating publishers, as well as for author manuscripts that have been submitted in compliance with the NIH Public Access Policy and similar policies of other research funding agencies.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pub/pubinfo/

Add a Journal to PMC

Participation in PMC is open to any English-language life sciences journal that meets NLM's standards for the archive. 
A journal must qualify on two levels, both the Scientific quality of the publication, and the Technical quality of its digital files.
A journal must provide PMC with the full text of articles in an XML (eXtensible Markup Language) format that conforms to an acceptable journal article DTD (Document Type Definition). PMC does not accept articles in HTML format.
NLM recommends that data be submitted in XML conforming to the NISO JATS Journal Publishing Tag Set, but PMC will also accept data in other full-text article DTDs that are widely used in life sciences journal publishing.

Files required for each deposited article:

  1. A separate XML data file for the full text of each article.
  2. The original high-resolution digital image files for all figures in each article.
  3. A PDF, if one exists, in addition to the XML version (but not as the only form.)
  4. Supplementary data files (e.g., spreadsheets or video files) available with the article.


JATS

JATS  is an application of NISO Z39.96-2015, which defines a set of XML elements and attributes for tagging journal articles and describes three article models.
The content on this site is the supporting documentation for the standard. JATS is a continuation of the NLM Archiving and Interchange DTD work begun in 2002 by NCBI.
https://jats.nlm.nih.gov/index.html

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/


File Validation Tools

extension Book

Book Interchange Tag Set: JATS Extension