Introduction
le point important est la certification CE et/ou FDA pour un usage médical.
Ici on présentera surtout les programmes open/libre.
j'avais posté un vieux billet il y a 10ans:
que sur mac
postDICOM
Logiciel d'imagerie DICOM : ce qu'il faut savoir si vous êtes un utilisateur Mac:
postcom est certifié CE orienté outils radiologue et reste un executable payant :
Il compare les autres services sur mac
Osirix MD prétend être un poste de travail d'imagerie médicale complet pour tous les services de radiologie. Il est facile à installer et peut être intégré à n'importe quel serveur PACS. Il propose des techniques de post-traitement avancées, notamment le rendu MPR, MIP, volume et surface. Il permet également une reconstruction incurvée, qui peut aider à tracer des vaisseaux tels que l'aorte ou les bronches. Il prend en charge la visualisation d'images 2D et offre également une prise en charge des images 4D telles que les acquisitions cardiaques
Osirix a obtenu l'approbation de la FDA pour l'imagerie diagnostique en médecine. Il possède également un label CE et est considéré comme un produit de classe IIa. Une version d'essai, Osirix lite, est disponible gratuitement. Cependant, il s'agit d'une version de démonstration, et toutes les images sont générées avec un filigrane. Il n'est pas homologué et n'est donc pas destiné à un usage médical.
Horos est un logiciel open source sous licence conçu par des radiologues au Royaume-Uni. Il est continuellement amélioré et mis à jour. Contrairement à Osirix lite, il offre de nombreuses fonctionnalités avancées, notamment MPR, MIP 3D, rendu de volume 3D, fusion d'images et d'autres outils de mesure.
Horos offre une assistance complète aux nouveaux utilisateurs, à la fois gratuite et payante. Ils proposent un didacticiel vidéo en quatre parties, ainsi qu'un guide d'utilisation détaillé. En outre, ils proposent également une assistance rémunérée où vous pouvez travailler en tête-à-tête avec un expert.
Horos propose un stockage d'images basé sur le cloud, à partir duquel des rapports peuvent être générés et partagés. L'abonnement gratuit permet de créer cinq rapports et cinq partages par mois. Cela peut être amélioré moyennant des frais. Les rapports peuvent être personnalisés pour répondre aux besoins de chaque cabinet. Horos propose également un assistant de migration Osirix, si vous souhaitez plutôt passer à cette application, sans perdre vos fonctionnalités et données enregistrées.
Miele LXIV
Miele LXIV est une autre visionneuse DICOM gratuite qui a été conçue exclusivement pour les utilisateurs de Mac. Il permet l'intégration avec tous les serveurs PACS. Il peut également importer facilement des fichiers DICOM à partir d'un lecteur de CD. Comme Horos, il offre des fonctionnalités avancées, notamment la MPR, le MIP, le rendu de volume 3D, la fusion d'images et l'imagerie 4D des scanners cardiaques. Il génère des modèles 3D interactifs qui permettent une meilleure orientation anatomique et une meilleure planification du traitement. Les images peuvent également être exportées vers d'autres applications Mac. Cette application est disponible en sept langues différentes, elle peut donc être utilisée par des professionnels du monde entier. Le logiciel est entièrement gratuit pour une utilisation non commerciale.
Visionneuse DICOM mRay
Il s'agit d'un logiciel DICOM gratuit pour Mac, conçu par une société allemande et compatible avec le système d'exploitation Mac. L'application a en fait été principalement conçue pour fonctionner sur les appareils mobiles, y compris l'iPad et l'iPhone. Une seule application sur l'appareil mobile aide les médecins à se connecter au PACS et à visualiser les images médicales des patients. Cependant, les fabricants ont averti que la visualisation d'images médicales sur des appareils mobiles doit être uniquement à des fins d'information, et qu'à des fins de diagnostic, une station de travail DICOM standard doit être utilisée. Cette visionneuse propose MPR, mais n'offre pas beaucoup d'autres fonctionnalités avancées. mRay ne peut être intégré au PACS que via un serveur mRay. Bien que la visionneuse soit gratuite, le serveur mRay n'est gratuit que pendant une période d'essai limitée, après quoi le paiement est requis.
Visionneuse 3 Dim
3Dimviewer est un logiciel DICOM gratuit compatible avec de nombreux systèmes d'exploitation, y compris Mac. Il s'agit d'un logiciel sous licence libre originaire de la République tchèque. Ce logiciel DICOM avancé possède des fonctionnalités telles que MPR, MIP et la fusion d'images. Il ne permet pas d'exporter vers des formats d'image plus simples. Il est léger et possède une interface très facile à utiliser. Donc, si vous venez de vous familiariser avec les applications DICOM, c'est un excellent logiciel à essayer.
Weasis
Weasis est une application puissante récemment publiée qui est compatible avec le système d'exploitation Mac, ainsi que d'autres systèmes tels que Windows et Linux. Il peut être intégré à plusieurs serveurs PACS. Bien qu'il permette la reconstruction 3D, la reconstruction multiplanaire et le MIP, il ne prend pas en charge la fusion d'images. Il permet de mesurer le SUV et a la capacité de créer des rapports structurés. L'une des caractéristiques uniques de Weasis est qu'en plus des images médicales, il est compatible avec les ECG. Cela serait utile aux cliniciens tels que les cardiologues et les médecins généralistes pour avoir une vue d'ensemble de la fonction cardiaque. Il permet d'importer des fichiers dans des formats d'image tels que JPEG et PNG. Weasis prétend offrir une assistance dans plusieurs langues. Le logiciel DICOM est entièrement gratuit pour une utilisation non commerciale.
OsiriX
Sur mac, pas mal de médecins utilisent osirix qui au départ fut "open" puis est devenu un produit commercial. La 1ere release date de avril 2004. En février 2010, les auteurs initiaux créent la société Pixmeo afin de certifier OsiriX au regard des exigences de la Food and Drug Administration et d'étendre l'offre de support qui se nomme "OsiriX MD". il existe toujours une version gratuite "OsiriX lite" avec bcp de limitations.
https://fr.wikipedia.org/wiki/OsiriX
https://github.com/pixmeo/osirix
https://github.com/OsiriX-Foundation
OsiriX is described as 'image processing software dedicated to DICOM images (".dcm" / ".DCM" extension) produced by imaging equipment (MRI, CT, PET, PET-CT, SPECT-CT, Ultrasounds, ...)
Remarque, seul DICOM est un format médical, NiFTI est pour la recherche. Osirix lite propose un plugin Nifti to dicom
Horos
Horos est un programme de visu d'images médicales libre et gratuit, que sur mac. L'objectif du projet Horos est de développer une visu d'images médicales 64 bits entièrement fonctionnelle pour Mac OS X. Horos est basée sur Osiris et d'autres bibliothèques d'imagerie médicale open source. Horos est disponible sous la licence GNU Lesser General Public License, Version 3 (LGPL-3.0).
la dernière release date d'avril 2020.
pour les plugin, les mettre dans
utlisateur/yourName/Bibliotheque/application Support/Horos/plugin
Remarque, seul DICOM est un format médical, NiFTI est pour la recherche. Heros hérite du fait que Osirix propose un plugin Nifti to dicom, et n'ouvre pas de manière native du nifti.
Miele LXIV
Initially forked from the OsiriX project.
The project started in November 2014 as a fork of the popular open source 32-bit project OsiriX, but it has been modified to become a 64-bit application and to remove many of the limitations of the 32-bit version.
- Built for macOS 10.13 through 13.3
l'application executable mac est devenu payante: 50€!
multiplateforme
-->les plus utilisés: 3D slicer et ITK-snap
3D Slicer
dernière release: 5.2.2 / 22 February 2023
Slicer started as a master's thesis project between the Surgical Planning Laboratory at the Brigham and Women's Hospital and the MIT Artificial Intelligence Laboratory in 1998.
C++ 82.1%; Python 10.7%
3D Slicer is built on VTK, a pipeline-based graphical library that is widely used in scientific visualization and ITK, a framework widely used for the development of image segmentation and image registration. In version 4, the core application is implemented in C++, and the API is available through a Python wrapper to facilitate rapid, iterative development and visualization in the included Python console. The user interface is implemented in Qt, and may be extended using either C++ or Python.
getting start:
ITK-snap
ITK-SNAP is the result of over 15 years of work by many researchers, software engineers and students.
release 4.0.0 ; 20 fev 2023
pour mac, OS≥11.0
C++
pas de script, que du clic souris
ne prend pas en charge image en 32bits que 16bits max.
new features 4.0.0:
after you install , go to: help/install command-line tools
ITK-SNAP is packaged with several useful command-line programs. Visit http://itksnap.org/cmdl for a listing of these tools.
To create links to these programs in /usr/local/bin, execute the following command in the Terminal App:
sudo /Applications/ITK-SNAP.app/Contents/bin/install_cmdl.sh
To create links in another directory 'my_directory', execute
sudo /Applications/ITK-SNAP.app/Contents/bin/install_cmdl.sh my_directory
To enable the tools for a single session, enter this command into the Terminal window:
export PATH=/Applications/ITK-SNAP.app/Contents/bin:$PATH
Weasis
Windows, Linux, and Mac OS
Visionneuse 3 Dim
2021
Il s'agit d'un logiciel sous licence libre originaire de la République tchèque. Ce logiciel DICOM avancé possède des fonctionnalités telles que MPR, MIP et la fusion d'images. Il ne permet pas d'exporter vers des formats d'image plus simples. Il est léger et possède une interface très facile à utiliser.
INVESALIUS
InVesalius generates 3D medical imaging reconstructions based on a sequence of 2D DICOM files acquired with Computed Tomography or Magnetic Resonance images equipments.
InVesalius has been developed since 2001 by Centro de Tecnologia da Informação Renato Archer (CTI), in Brazil.
derniere release 3.1.1 (18 août 2017)
MRIcron
MRIcron is a cross-platform NIfTI format image viewer. It can load multiple layers of images, generate volume renderings and draw volumes of interest. It also provides dcm2nii for converting DICOM images to NIfTI format and NPM for statistics.
mricron: 2-September-2019 (v1.0.20190902) release
online
imageJ
très utilisé en biophotonique pour le traitement 2D
mais on peut l'utiliser avec des plugin 3D view.
il peut lire du format nifti avec
freesurfer, spécialisé brain
release 7.3.3 (9 septembre 2022)
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outils deep learning
Nilearn: Machine learning for Neuro-Imaging in Python, is a software package to facilitate the use of statistical learning on NeuroImaging data.
Namely Nilearn leverages the scikit-learn Python toolbox for multivariate statistics with applications such as predictive modelling, classification, decoding, or connectivity analysis.
INRIA
Release 0.10.0, janv 2023
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