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Monday, April 16, 2018

Mars 2018: affrontement entre couperin et springer; French Scientists Petition for Firm Stance Against Springer



En mars 2018, les négociations entre le consortium Couperin.org —  (250 institutions academiques dont le CNRS et les grandes universités font partie) — et Springer (Springer Nature) se sont achevées sur un constat de désaccord, l’éditeur ayant refusé la dernière proposition du consortium qui demandait une baisse de l’ordre de 15 % du tarif des abonnements. Couperin.org juge en effet inacceptable la dernière offre de Springer qui proposait une hausse de prix de 0 % en 2018, 0,75 %  en 2019 et 1 % en 2020 pour l’offre dite « big deal » pour un bouquet de revues.

Les prix des abonnements aux ressources électroniques, en hausse constante depuis vingt ans, génèrent des bénéfices importants pour les grands éditeurs scientifiques que sont Springer et Elsevier, alors même qu’une proportion non négligeable et croissante (au minimum de 4 % selon Springer, mais probablement plus proche de 15 %, selon les calculs de Couperin.org pour le bouquet en négociation) des articles publiés dans les revues concernées par les abonnements sont en accès libre. Le coût de cet accès pour ces articles est assumé par les auteurs ou leurs institutions et versé aux éditeurs. Pourquoi dès lors faire payer l’accès via l’abonnement quand l’éditeur a déjà été financé?

Afin de tenir compte de cet état de fait, les négociatrices avaient demandé une baisse au moins égale à la part déjà prise en charge pour ces articles. Cette demande n’a été pas été totalement entendue par Springer qui a proposé une baisse très insuffisante de ses tarifs.

Faute d’accord, Springer a indiqué qu’il couperait les accès à ces contenus au 1er avril. Les chercheurs ne pourront donc plus consulter les articles parus en 2018 dans les revues du bouquet diffusé par Springer sauf par des voies de substitution (« dépôts » de prépublications, réseaux sociaux, demande à l’auteur, etc.) Les articles parus avant 2018 demeureront accessibles pour les établissements de l'ESR. En effet, selon les termes des contrats précédents, pendant au moins deux ans et sans frais supplémentaire, les chercheurs conserveront l'accès à une grande partie des archives des ressources acquises jusqu'en 2017. Cela inclut, pour le CNRS, les ressources figurant dans l’abonnement antérieur  (2015-2017) ainsi que les ressources acquises de manière définitive dans le cadre du projet Istex (origine à 2014 pour les revues Springer).

La décision française intervient dans un contexte de fortes tensions au niveau international. Plusieurs communautés scientifiques se mobilisent pour enrayer cette spirale inflationniste des budgets de documentation scientifique. L’université de Montréal s’est désabonnée en 2016 du bouquet complet ou encore le Danemark qui demande de meilleurs prix et plus de services pour les chercheurs.

La pétition

https://www.change.org/p/springer-nous-pouvons-nous-en-passer-springer-we-can-do-without

Ref

http://www.cnrs.fr/inshs/recherche/springer.htm

In English

French Scientists Petition for Firm Stance Against Springer
More than 2,000 signatories urge a national consortium of French academic institutions to refuse an increase in journal subscription fees.
A group of researchers at the French National Center for Scientific Research (CNRS) started an online petition last weekend (April 8) to publically support Couperin.org, a national consortium representing more than 250 academic institutions in France, in its fee negotiations with academic publisher SpringerNature. More than 2,000 people have signed the petition so far.

“We are employed by the institutions members of Couperin. As such, our work will be directly affected should Springer eventually decide to enact their decision and shut down access to their recent contents,” the petition states. “However, we support the firm stance taken by Couperin and we are ready to endure this relative discomfort for as long as it will be necessary to bring Springer to acceptable propositions.”

See “French Universities Cancel Subscriptions to Springer Journals” 
Fee negotiations between Couperin.org and SpringerNature regarding one of the publisher’s platforms, Springer—which alone has more than 2,000 journals—are stuck in a stalemate. The key point of contention is a rise in subscription costs, which the consortium believes should be reduced in light of the rising proportion of expensive open-access papers.

Last month, the consortium announced that French universities and research organizations would not renew their Springer subscriptions due to this disagreement.

The publisher told The Scientist last month that it would maintain institutions’ access to its journals while in negotiations. If that agreements ends, French scientists are willing to deal with the repercussions. “No more direct access to Springer’s latest papers? No problem,” the petition states. “There are so many ways [to access papers]: institutional depositories, social networks, direct requests to the authors… We are not worried.”

Ref

Tuesday, May 23, 2017

comparison figshare versus zenodo






Zenodo

see my posts (tag zenodo)

HTML of figshare

9 fields (input)


HTML


Three levels of services

  1. general features for FREE accounts
  2. services for publishers
    1. figshare Viewer
    2. visualize any format of supplemental and digital files within your articles
  3. services for institutions
    1. Curation workflows
    2. manage the curation of files to be made public, control quotas and administer rights
https://figshare.com/features

 additional custom METADATA

Public files hosted on figshare are issued with Digital Object Identifiers (DOIs) via DataCite through the California Digital Library. In order to meet with DataCite metadata requirements, figshare requires users to add the following information before making files public and citable: Title, author list (ordered), categories (set ontology), tags (free text) and a description with as much context as needed to interpret the files. Users can also add links to external sources.

Institutional clients can define additional custom metadata when implementing figshare.
https://support.figshare.com/support/solutions/articles/6000079087-metadata-and-dois

Profile: All about your profile page

https://support.figshare.com/support/solutions/articles/6000088096-profile-all-about-your-profile-page

Example of a publisher 

https://plos.figshare.com/

Other programmatic tools (in GitHub)

https://github.com/search?utf8=%E2%9C%93&q=figshare


comparison of 2 open archives: figshare zenodo


Zenodo

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HTML of figshare

9 fields (input)


HTML


Three levels of services

  1. general features for FREE accounts
  2. services for publishers
    1. figshare Viewer
    2. visualize any format of supplemental and digital files within your articles
  3. services for institutions
    1. Curation workflows
    2. manage the curation of files to be made public, control quotas and administer rights
https://figshare.com/features

Additional custom METADATA

Public files hosted on figshare are issued with Digital Object Identifiers (DOIs) via DataCite through the California Digital Library. In order to meet with DataCite metadata requirements, figshare requires users to add the following information before making files public and citable: Title, author list (ordered), categories (set ontology), tags (free text) and a description with as much context as needed to interpret the files. Users can also add links to external sources.

Institutional clients can define additional custom metadata when implementing figshare.
https://support.figshare.com/support/solutions/articles/6000079087-metadata-and-dois

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https://support.figshare.com/support/solutions/articles/6000088096-profile-all-about-your-profile-page

Example of a publisher 

https://plos.figshare.com/

Other programmatic tools (in GitHub)

https://github.com/search?utf8=%E2%9C%93&q=figshare

Monday, March 13, 2017

dissemin impactstory web service déposer sur des archives ouvertes Zenodo HAL



Dissemin est à comparer à https://impactstory.org/
qui lui ne propose que de relier vos références (qu'il trouve) à des liens URL (No free fulltext anywhere? Consider uploading this work to an open repository like Zenodo or Figshare.)
Dissemin vous aide à trouver et à uploader.
Dissemin http://dissem.in/

C'est un web service encourageant les chercheurs à diffuser leurs publications librement.
Dissemin propose une plateforme web qui récolte des métadonnées à partir de différentes sources et qui détermine la disponibilité du texte intégral des publications des chercheurs. Il a été conçu pour encourager l'usage des dépôts (plutôt que les pages personnelles).

Les chercheurs ont souvent le droit de mettre leurs articles en accès libre sur le Web, pour compléter la version payante proposée par les éditeurs traditionnels. Pourtant, tous ne le font pas.

À cause de cela, les bibliothèques doivent payer à prix d'or des abonnements électroniques aux journaux de recherche, ce qui grève leurs finances et limite leur offre.

C'est déjà bien de mettre vos articles en ligne sur votre page Web, mais ce n'est pas suffisant ! De telles copies sont moins pérennes et plus difficiles à trouver que celles qui sont déposées dans des dépôts bien indexés.

Dissemin cherche des copies de vos articles dans une grande collection de dépôts ouverts en ligne, et vous indique ceux qu'il n'a pas pu trouver de cette façon.

Il propose aussi le service de chercher les références dans wikipedia et de les lier à des documents open access dans des archives ouvertes.

Quand nous l'avons trouvé dans l'un des dépôts que nous parcourons. La liste de ces dépôts est à voir ci-dessous.

Sources primaires


  • CrossRef.org
  • BASE (Bielefeld Academic Search Engine); grâce au moteur de recherche BASE, nous avons accès à plus de 80 millions de ref.
  • SHERPA/RoMEO
  • Zotero

Sources secondaires

Moissonnées avec le protocole OAI-PMH.

  • arXiv
  • HAL
  • PubMed Central
  • OpenAIRE
  • DOAJ
  • Persée
  • Cairn.info
  • Numdam

http://dissem.in/sources

Quelques personnes ont créé une associations 'CAPSH' qui gère certains aspects de dissemin:
CAPSH (Committee for the Accessibility of Publications in Sciences and Humanities) is a French nonprofit association promoting the open access to academic publications. It is in charge of the Dissemin project.

Liste des présentation à des congrès conf:

https://association.dissem.in/index.html.fr

process

On se connecte avec son ORCID id à
http://dissem.in/

Il trouve les fichiers et les classe suivant l'accord avec l'éditeur.
Puis il permet de faire de l'upload vers ZENODO (avec peu de metadata)
(et aussi vers HAL voir ci-dessous).

Le site a aussi une fonction "profile" qui liste vos file et vos dépôt (upload).

FAQ


Documentation

Les dépôts

Quel dépôt utiliser ?
Il y a en gros trois types de dépôts :
Les dépôts thématiques, qui se limitent à certains domaines précis, comme arXiv.
Les dépôts institutionnels, dédiés à l'archivage de la production scientifique d'une institution ou d'un pays.
Les dépôts académiques génériques comme Zenodo, dont le périmètre n'est limité qu'aux données issues de la recherche.
Si votre communauté scientifique préfère un dépôt thématique particulier, il vaut mieux l'utiliser afin d'améliorer votre visibilité. Dans le cas contraire, les dépôts institutionnels ou génériques sont également une option raisonnable.

ZENODO HAL 

Pourquoi ne puis-je pas déposer dans mon dépôt favori pour l'instant ?

Pour l'instant, nous vous proposons seulement de déposer vos articles dans les dépôts suivants :
  • Zenodo, un dépôt innovant soutenu par l'UE.
  • HAL, un dépôt français géré par le CCSD
Pour proposer davantage de dépôts, il faut que nous écrivions du code spécifique à chaque dépôt, mais il faut surtout que ces dépôts nous donnent l'autorisation de déposer des papiers en masse. Nous avons envisagé d'intégrer les dépôts suivants :
arXiv, un dépôt généraliste bien connu. Pour l'instant, arXiv n'autorise pas Dissemin à déposer en utilisant leur API SWORD, et demande aux utilisateurs de déposer dans arXiv manuellement. Si vous voudriez utiliser Dissemin pour déposer vos articles dans arXiv, n'hésitez pas à les contacter.

CCSD HAL

Il permet à chaque chercheur de mesurer l’accessibilité de ses publications et de mettre en ligne en quelques clics celles qui ne sont pas déjà librement disponibles. Plus besoin de saisir manuellement les métadonnées (titre, auteurs ou identifiants variés) : celles-ci sont automatiquement renseignées par Dissemin.
Cette fonctionnalité est rendue possible par l’exploitation de deux sources de données : le Bielefeld Academic Search Engine (BASE) et Crossref, qui couvrent presque 100 millions de publications.

Jusqu’à présent, les documents ainsi rendus librement accessibles étaient hébergés par Zenodo, un dépôt appartenant au CERN. Les chercheurs de toutes disciplines souhaitant déposer dans HAL peuvent désormais aussi utiliser Dissemin comme canal de dépôt depuis début 2017.

Dissemin utilise l’import SWORD pour déposer les publications. Celles-ci suivent le parcours classique de vérification avant d’être mises en ligne.  Les dépôts effectués par Dissemin seront rattachés au compte utilisateur de l’auteur dans HAL à partir de l’identifiant ORCID. Pour cela il faudra juste que l’auteur ait associé son compte HAL avec son ORCID.
Cette réalisation est le fruit d’un partenariat entre le Consortium Couperin, le CCSD, et le CAPSH, qui développe Dissemin.
https://www.ccsd.cnrs.fr/2017/03/deposer-dans-hal-avec-dissemin/

GitHub

Le code source est sur GitHub
python
https://github.com/dissemin/dissemin

Puis-je récolter vos données ?

Oui ! Nous avons même une API. Si vous n'êtes pas satisfait par ce qu'elle propose, n'hésitez pas à nous contacter.
http://dev.dissem.in/#api

Thursday, March 9, 2017

ZENODO export functions. Very good for JSON, DataCite XML and Marc21 XML (and DublinCore-OAI-PMH )


ZENODO

Zenodo puts only 4 bibliographic fields in metadata of each page!
Then the import with Zotero (with metadata translator) is quite bad...

example:
https://zenodo.org/record/376087

This article was published with an input of 20 zenodo fields
(+2 : zenodo automatically add DOI field and 'zenodo id' field).

access_right
"open"
communities
...
contributors
...
creators
...
description
" <b>  Sommaire de ce volume 18 de la Collection<br /> -- <i>Intégrations des savoirs et savoir faire</i> -- </b> <br /> <i> Matériaux et Joints d Etanchéité pour les hautes pressions.</i> <ul> <li>Préface / Dominique Leguillon</li><li>P. 13; Introduction générale / Patrick Boissinot, Patrick Langlois, Agílio A.H. Pádua</li><li>P. 17; Introduction au dimensionnement / Agílio A.H. Pádua; <br /> 1 Définition du problème; 2 Dimensionnement; 3 Obturateurs; 4 Conclusion</li><li>P. 27; Frettage et autofrettage / Patrick Langlois;<br /> 1 Considérations préliminaires au frettage; 2 Frettage d une enceinte bibloc; 3 Frettage d une enceinte multibloc; 4 Formulation de l autofrettage; 5 Modes de réalisation de l autofrettage; 6 Conclusion</li><li>P. 51; Méthodes d éléments finis en calcul de structures élastiques / Joël Frelat;<br /> 1 Introduction; 2 Rappel de la formule théorique; 3 Formulation variationnelle; 4 Formulation numérique; 5 Etapes d une mise en oeuvre pratique; 6 Conclusion Extension aux problèmes non linéaires</li><li>P. 61; Les matériaux sidérurgiques et les hautes pressions / Jean-Paul Dichtel; <br /> 1 Caractérisation mécanique des aciers; 2 Métallurgie des aciers et superalliages; 3 Commentaires : la Directive Européenne Appareils à Pression</li><li>P. 73; Les métaux non ferreux Alliage cuivre-béryllium et titane / Jean-Pierre Petitet; <br /> 1 Introduction; 2 Le cuivre-béryllium; 3 Le titane</li><li>P. 81; Les Carbures cémentés WC-Co / Emmanuel Pauty;<br />  1 Les procédés de fabrication; 2 Les propriétés des carbures cémentés; 3 Conclusions</li><li>P. 95; Choix et usinage des carbures de tungstène / Jacques Calzas;<br />  1 Choix des carbures de tungstène; 2 Usinage du carbure de tungstène</li><li>P. 107; Céramiques et matériaux pour l optique / Jean-Claude Chervin;<br />  1 Céramiques; 2 Matériaux pour l optique</li><li>P. 137; Types de joints et de montage / Roger Argoud et Jacques Roux;<br />  1 Introduction; 2 Généralités; 3 Joints à basse pression; 4 Joints cône sur cône; 5 Joints Bridgman Champignon; 6 Joints annulaires auto-serrés; 7 Joints coniques d Amagat; 8 Autres joints; 9 Conclusion</li><li>P. 157; Joints hautes pressions pour la compression de gros volumes solides / Sylvie Le Floch;<br />  1 Joints solides utilisés dans les différents types d enceintes hautes pressions; 2 Matières premières des joints; 3 Assemblages HP-HT</li><li>P. 169; Le matériel standard / Jean-Pierre Petitet;<br />  1 Tubes, conduites et raccords; 2 Les vannes; 3 Quelques types d enceintes commercialisées; 4 Les générateurs de pression; 5 Le matériel moins standard</li><li>P. 183; Assemblages haute pression / Gérard Hamel;<br />  1 Montage des raccords de pressions; 2 Montage de quelques passages électriques; 3 Les passages de thermocouple; 4 Les passages optiques, montage des fenêtres; 5 Montage des joints et des obturateurs sur une cellule haute pression</li><li>P. 193; Usinage / Jean-Pierre Michel;<br />  1 Introduction; 2 Les joints de faible épaisseur; 3 Les bagues anti-extrusion à 45; 4 Les joints à 45; 5 Les joints  double Bridgman ; 6 Les joints plats en élastomères; 7 Les joints en indium (étanchéité en hélium et azote liquide; 8 Joints métal-métal type Lens ring; 9 Les passages du courant; 10 Usinage de matériaux exotiques</li><li>P. 207; Les règles de sécurité / Patrick Boissinot;<br />  1 Dangers présentés par les appareils à pression; 2 Appareils à pression rencontrés dans les laboratoires et facteurs de risques; 3 Principes généraux de prévention et réglementation; 4 Moyens de protection; 5 Conclusion</li> </ul> "
imprint_isbn
"978-2918701040"
imprint_place
"Meudon, France"
imprint_publisher
"MRCT-CNRS"
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...
license
"cc-by-nc-nd-4.0"
notes
" Licence CC-BY-NC-ND. Ce volume (cet ISBN) est une 3ième édition. Collection -- Intégrations des savoirs et savoir faire -- dirigée par Stéphane MOTTIN. Lien: http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour trouver cet ouvrage en bibliothèque). Ce PDF contient des metadata bibliographiques directement utilisables par exemple par Jabref (logiciel open source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en haut à gauche). Le sommaire détaillé avec structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des citations croisées internes à l ouvrage."
partof_pages
"51-60 "
partof_title
"Matériaux et joints d étanchéité pour les hautes pressions"
publication_date
"2011-04-15"
publication_type
"section"
references
...
related_identifiers
...
subjects
...
title
" Méthodes d’éléments finis en calcul de structures élastiques "
upload_type
"publication"

You can export in 7 formats:

  1. bibTeX
  2. CSL
  3. DataCite
  4. DublinCore
  5. JSON
  6. MarcXML
  7. Mendeley

bibTeX

@misc{frelat_joel_2011_376087,
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                   élastiques}},
  month        = apr,
  year         = 2011,
  note         = {{Licence CC-BY-NC-ND.  Ce volume (cet ISBN) est une 
                   3ième édition.   Collection -- Intégrations des
                   savoirs et savoir faire --         dirigée par
                   Stéphane MOTTIN.  Lien:
                   http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour
                   trouver cet ouvrage en bibliothèque).  Ce PDF
                   contient des metadata bibliographiques directement
                   utilisables par exemple par Jabref (logiciel open
                   source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et
                   balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en
                   haut à gauche). Le sommaire détaillé avec
                   structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs
                   résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des
                   citations croisées internes à l ouvrage.}},
  doi          = {10.5281/zenodo.376087},
  url          = {https://doi.org/10.5281/zenodo.376087}
}
only 7 fields!!!
very bad.

CSL Citation Style Language JSON Export

only 13 fields
abstract
"<p><strong>  Sommaire de ce volume 18 de la Collection<br> -- <em>Intégrations des savoirs et savoir faire</em>-- </strong><br> <em>Matériaux et Joints d Etanchéité pour les hautes pressions.</em></p> <ul> <li>Préface / Dominique Leguillon</li> <li>P. 13; Introduction générale / Patrick Boissinot, Patrick Langlois, Agílio A.H. Pádua</li> <li>P. 17; Introduction au dimensionnement / Agílio A.H. Pádua;<br> 1 Définition du problème; 2 Dimensionnement; 3 Obturateurs; 4 Conclusion</li> <li>P. 27; Frettage et autofrettage / Patrick Langlois;<br> 1 Considérations préliminaires au frettage; 2 Frettage d une enceinte bibloc; 3 Frettage d une enceinte multibloc; 4 Formulation de l autofrettage; 5 Modes de réalisation de l autofrettage; 6 Conclusion</li> <li>P. 51; Méthodes d éléments finis en calcul de structures élastiques / Joël Frelat;<br> 1 Introduction; 2 Rappel de la formule théorique; 3 Formulation variationnelle; 4 Formulation numérique; 5 Etapes d une mise en oeuvre pratique; 6 Conclusion Extension aux problèmes non linéaires</li> <li>P. 61; Les matériaux sidérurgiques et les hautes pressions / Jean-Paul Dichtel;<br> 1 Caractérisation mécanique des aciers; 2 Métallurgie des aciers et superalliages; 3 Commentaires : la Directive Européenne Appareils à Pression</li> <li>P. 73; Les métaux non ferreux Alliage cuivre-béryllium et titane / Jean-Pierre Petitet;<br> 1 Introduction; 2 Le cuivre-béryllium; 3 Le titane</li> <li>P. 81; Les Carbures cémentés WC-Co / Emmanuel Pauty;<br>   1 Les procédés de fabrication; 2 Les propriétés des carbures cémentés; 3 Conclusions</li> <li>P. 95; Choix et usinage des carbures de tungstène / Jacques Calzas;<br>   1 Choix des carbures de tungstène; 2 Usinage du carbure de tungstène</li> <li>P. 107; Céramiques et matériaux pour l optique / Jean-Claude Chervin;<br>   1 Céramiques; 2 Matériaux pour l optique</li> <li>P. 137; Types de joints et de montage / Roger Argoud et Jacques Roux;<br>   1 Introduction; 2 Généralités; 3 Joints à basse pression; 4 Joints cône sur cône; 5 Joints Bridgman Champignon; 6 Joints annulaires auto-serrés; 7 Joints coniques d Amagat; 8 Autres joints; 9 Conclusion</li> <li>P. 157; Joints hautes pressions pour la compression de gros volumes solides / Sylvie Le Floch;<br>   1 Joints solides utilisés dans les différents types d enceintes hautes pressions; 2 Matières premières des joints; 3 Assemblages HP-HT</li> <li>P. 169; Le matériel standard / Jean-Pierre Petitet;<br>   1 Tubes, conduites et raccords; 2 Les vannes; 3 Quelques types d enceintes commercialisées; 4 Les générateurs de pression; 5 Le matériel moins standard</li> <li>P. 183; Assemblages haute pression / Gérard Hamel;<br>   1 Montage des raccords de pressions; 2 Montage de quelques passages électriques; 3 Les passages de thermocouple; 4 Les passages optiques, montage des fenêtres; 5 Montage des joints et des obturateurs sur une cellule haute pression</li> <li>P. 193; Usinage / Jean-Pierre Michel;<br>   1 Introduction; 2 Les joints de faible épaisseur; 3 Les bagues anti-extrusion à 45; 4 Les joints à 45; 5 Les joints  double Bridgman ; 6 Les joints plats en élastomères; 7 Les joints en indium (étanchéité en hélium et azote liquide; 8 Joints métal-métal type Lens ring; 9 Les passages du courant; 10 Usinage de matériaux exotiques</li> <li>P. 207; Les règles de sécurité / Patrick Boissinot;<br>   1 Dangers présentés par les appareils à pression; 2 Appareils à pression rencontrés dans les laboratoires et facteurs de risques; 3 Principes généraux de prévention et réglementation; 4 Moyens de protection; 5 Conclusion</li> </ul>"
author
...
container_title
"Matériaux et joints d étanchéité pour les hautes pressions"
DOI
"10.5281/zenodo.376087"
id
"376087"
ISBN
"978-2918701040"
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...
note
"Licence CC-BY-NC-ND. Ce volume (cet ISBN) est une 3ième édition. Collection -- Intégrations des savoirs et savoir faire -- dirigée par Stéphane MOTTIN. Lien: http://www.sudoc.fr/155436619 (voir SUDOC pour trouver cet ouvrage en bibliothèque). Ce PDF contient des metadata bibliographiques directement utilisables par exemple par Jabref (logiciel open source pour bibTeX). Ce PDF est structuré et balisé (voir en dessous de preview ci-dessous en haut à gauche). Le sommaire détaillé avec structure sur 2 niveaux est indiqué dans le champs résumé dans le but du (Linked Open DATA) et des citations croisées internes à l ouvrage."
page
"51-60"
publisher
"MRCT-CNRS"
publisher_place
"Meudon, France"
title
"Méthodes d'éléments finis en calcul de structures élastiques"
type
"chapter"

no contributors
no licence (i put in the "note" field")...

DataCite XML Export

Zenodo gives a DataCite DOI then he must provide clean datacite METADATA to DataCite.

with XML tree view:



It's a clean XML DataCite 3.1
<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<resource 
xmlns:xsi= "http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
xmlns="http://datacite.org/schema/kernel-3" 
xsi:schemaLocation="http://datacite.org/schema/kernel-3 http://schema.datacite.org/meta/kernel-3/metadata.xsd">

<!--
 Revision history
     2010-08-26   Complete revision according to new common specification by the metadata work group after review. AJH, DTIC
2010-11-17 Revised to current state of kernel review, FZ, TIB 
2011-01-17 Complete revsion after community review. FZ, TIB
2011-03-17 Release of v2.1: added a namespace; mandatory properties got minLength; changes in the definitions of relationTypes
IsDocumentedBy/Documents and isCompiledBy/Compiles; changes type of property "Date" from xs:date to xs:string. FZ, TIB
2011-06-27 v2.2: namespace: kernel-2.2, additions to controlled lists "resourceType", "contributorType", "relatedIdentifierType", and "descriptionType". Removal of intermediate include-files.
     2013-05 v3.0: namespace: kernel-3.0; delete LastMetadataUpdate & MetadateVersionNumber; additions to controlled lists "contributorType", "dateType", "descriptionType", "relationType", "relatedIdentifierType" & "resourceType"; deletion of "StartDate" & "EndDate" from list "dateType" and "Film" from "resourceType";  allow arbitrary order of elements; allow optional wrapper elements to be empty; include xml:lang attribute for title, subject & description; include attribute schemeURI for nameIdentifier of creator, contributor & subject; added new attributes "relatedMetadataScheme", "schemeURI" & "schemeType" to relatedIdentifier; included new property "geoLocation" 
2014-08-20 v3.1: additions to controlled lists "relationType", contributorType" and "relatedIdentifierType"; introduction of new child element "affiliation" to "creator" and "contributor"
-->
only one field is empty:
no "CC-BY-NC-ND"

DublinCore (and OAI-PMH)

It's an XML with
http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"
<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<oai_dc:dc xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:oai_dc="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd">

The field "notes " is empty.

It's for OAI-PMH Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting
http://www.openarchives.org/pmh/
The Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting (OAI-PMH) is a low-barrier mechanism for repository interoperability. Data Providers are repositories that expose structured metadata via OAI-PMH. Service Providers then make OAI-PMH service requests to harvest that metadata. OAI-PMH is a set of six verbs or services that are invoked within HTTP.

and DublinCore
http://dublincore.org/documents/2012/06/14/dcmi-terms/?v=elements


JSON

It's the same METADATA JSON uploaded

1/    with unicode encoding /u  (for example for "é" -> \u00e9)
2/    with a beautify/format transform of JSON
3-a/ with at the beginning
{"created": "2017-03-09T10:05:09.248886+00:00", 
  "doi": "10.5281/zenodo.376087", 
  "id": 376087, 
  "links": {
    "badge": "https://zenodo.org/badge/doi/10.5281/zenodo.376087.svg", 
    "doi": "https://doi.org/10.5281/zenodo.376087", 
    "html": "https://zenodo.org/record/376087"
  }, 

3-b/ and at the end
owners": [
    2222
  ], 
  "revision": 0, 

  "updated": "2017-03-09T10:05:09.248893+00:00"


MarcXML

very good (all fields) but it's an old marc format (good for librarians)
and XML format
<record xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim">

Mendeley

it's not an export but just a link to export
with only 3 METADATA {title, author and DOI} 
and a web service of automatic upload of PDFs.
If you have already the reference in Mendeley, it could be OK.
(I import my bibTeX references (JabRef) with Desktop Mendeley app and sync but problem, many fields 'notes' 'editor' = 0...).


Conclusion 

  • Very good for JSON, DataCite XML and Marc21 XML.
  • 'notes' lacks with the export DublinCore-OAI-PMH.
  • Put your BibTeX reference in your PDF.






Finding a research data article repository archive


Whether you're looking for data to reuse or integrate with your research, or trying to find somewhere to deposit your own data, a relevant data repository (also known as an archive or data centre) is a good place to start.

https://www.imperial.ac.uk/research-and-innovation/support-for-staff/scholarly-communication/research-data-management/archival-and-preservation/finding-a-research-data-repository--archive/

Discipline-specific repositories

The best place to start is a repository that focuses specifically on the types of data you work with. There are thousands of these available, but you can easily browse by subject area in the Registry of Research Data Repositories (re3data) to find something suitable.

General-purpose repositories

If there isn't a suitable specialised repository, we recommend trying one or more of the following more general options:

Zenodo 

example:
https://zenodo.org/record/375921
An open access data, software and publication repository for researchers who want to share multidisciplinary research results not available in other repositories. It was developed by and is hosted at CERN, but is suitable for all types of research data. It is free to use and has guaranteed funding from the EU for the foreseeable future.

dryad

http://datadryad.org/
only datasets
Dryad is built upon the open-source DSpace repository software. All customizations not available within the main DSpace distribution are available from the Dryad code repository under an open source (new BSD) license.
Dryad supports multiple ways of receiving article or manuscript metadata from publishers. The simplest method involves reading email notifications, but we are also implementing a REST API for those desiring greater control over the data deposition process.
Digital Object Identifers provided by DataCite through EZID

datahub Open Knowledge Foundation

https://datahub.io/
CKAN is a tool for managing and publishing collections of data. It is used by national and local governments, research institutions, and other organisations which collect a lot of data. With its powerful search and faceting, users can browse and find the data they need, and preview it using maps, graphs and tables - whether they are developers, journalists, researchers, NGOs, citizens or your own colleagues.

CKAN is free, open-source software, which has been developed by the Open Knowledge Foundation since 2006 and used by government and organisations around the world. Version 2.0 was released in May 2013.


Wednesday, March 8, 2017

process for adding a journal/article to PubMed Central (PMC) and JATS (Journal Article Tag Suite)

PMC

PMC is a free archive of biomedical and life sciences journal literature at the U.S. National Institutes of Health's National Library of Medicine (NIH/NLM). It is a repository for journal literature deposited by participating publishers, as well as for author manuscripts that have been submitted in compliance with the NIH Public Access Policy and similar policies of other research funding agencies.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pub/pubinfo/

Add a Journal to PMC

Participation in PMC is open to any English-language life sciences journal that meets NLM's standards for the archive. 
A journal must qualify on two levels, both the Scientific quality of the publication, and the Technical quality of its digital files.
A journal must provide PMC with the full text of articles in an XML (eXtensible Markup Language) format that conforms to an acceptable journal article DTD (Document Type Definition). PMC does not accept articles in HTML format.
NLM recommends that data be submitted in XML conforming to the NISO JATS Journal Publishing Tag Set, but PMC will also accept data in other full-text article DTDs that are widely used in life sciences journal publishing.

Files required for each deposited article:

  1. A separate XML data file for the full text of each article.
  2. The original high-resolution digital image files for all figures in each article.
  3. A PDF, if one exists, in addition to the XML version (but not as the only form.)
  4. Supplementary data files (e.g., spreadsheets or video files) available with the article.


JATS

JATS  is an application of NISO Z39.96-2015, which defines a set of XML elements and attributes for tagging journal articles and describes three article models.
The content on this site is the supporting documentation for the standard. JATS is a continuation of the NLM Archiving and Interchange DTD work begun in 2002 by NCBI.
https://jats.nlm.nih.gov/index.html

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/


File Validation Tools

extension Book

Book Interchange Tag Set: JATS Extension