Wednesday, September 21, 2016

comparaison des moteurs et metamoteurs spécialisés emplois et stages (job board): premier job. Les stratégies de recherche... Exemple: emploi stage Tourisme.

Le plus souvent un chômeur, une personne en recherche de reconversion, ou un étudiant utilisent des moteurs généraux comme google ou bing avec ses mots clés.
Le moteur de recherche est un des services web "one-click service" les plus utilisés mais hélas souvent peu efficace pour un ciblage efficace.
Comme toujours il faut activer le réflexe des moteurs spécialisés.

Un site d'emploi (en anglais, jobboard ou job board)  affiche des offres d'emploi avec un moteur plus ou moins perfectionné.
Ces offres se situent dans le web visible.
Certaines sociétés par exemple d'interim ou hyper-spécialisé comme les chasseurs de tête nécessitent de passer par leur propres moteurs qui génèrent la liste des offres à la volée.

En outre, pour une recherche "premier job" c'est souvent le néant pour la majorité des sites car le terme "débutant accepté" est utilisé.
"l’addition de ces trois outils (stages, apprentissage et césure) concourt à près de 40 % des recrutements. Loin devant la navigation sur les sites Internet et les réseaux sociaux, qui ne donne des résultats probants que dans 17 % des cas. Pas de doute, l’expérience acquise en entreprise s’avère payante lorsqu’il s’agit de décrocher un emploi."
Ref: http://focuscampus.blog.lemonde.fr/2016/06/16/premier-emploi-entreprises-recherchent-jeunes-diplomes-experimentes/

De plus il existe des offres "stage" qui sont en fait des emplois déguisés (>6mois).

Le décret d’application de la loi du 10 juillet 2014 sur l’encadrement des stages:
Ils sont limités à 6 mois et donnent droit à 554 euros de gratification pour 154 heures de travail mensuel (si >2mois et pas de gratification si deux stages de moins de deux mois avec une période de carence d’une semaine entre les deux).
Un stagiaire a le droit au ticket restaurant.
Quelques données sur le cadre des stages en France:
http://www.intellego.fr/actualites/education/la-proposition-de-loi-sur-l-encadrement-des-stages-passe-le-cap-de-la-cmp/14519
http://www.intellego.fr/actualites/education/ces-entreprises-qui-paient-le-mieux-les-stagiaires/14348

Mais il ne faut pas se perdre avec cette stratégie "moteur spécialisé".  
Il existe d'autres stratégies. Prenons un exemple de domaine:

 l'industrie du tourisme

1/vers des sociétés qui recrutent ce qui n'est jamais facile. Il faut s'orienter vers des revues spécialisées
http://www.press-directory.com/presse-professionnelle/presse-professionnelle-tourisme.html
 par exemple http://www.lechotouristique.com/
certains proposent des offres:
http://tour-hebdo.clicandtour.fr/emploi.aspx?utm_source=wk-th&utm_medium=site-partenaire&utm_campaign=fil-offre
et chercher les actualités des sociétés qui recrutent:
http://www.tourmag.com/Les-entreprises-qui-recrutent_r199.html


2/vers le domaine des syndicats nationaux comme pour les métiers du tourisme:
SNAV, Syndicat National des Agents de Voyages
http://www.easyvoyage.com/pratique/l-aps-le-ceto-et-le-snav-3-organismes-cles-du-tourisme-18
ou les fédérations:
https://www.fftst.org/offres/emploi.php
ou agence de développement
http://atout-france.fr/notre-reseau/belgique

3/les associations spécialisées:
http://www.snav.org/Snav/public?controller=fr.amadeuspro.fo.StandardContent&sectionID=HomePublic%23actualites-tourisme&publicationID=publi_1456307240166248_fr_1&cp=1

4/les congrès, les salons internationaux de tourisme (Madrid pour le marché latino-amé-
ricain http://www.ifema.es/fitur_06/, Dubaï pour le marché du Moyen-Orient...),
https://www.salons-du-tourisme.com/Paris
https://www.salons-du-tourisme.com/index.php/Paris/Liste-des-exposants

5/suivre les nouvelles technologies du domaine comme le moteur de recherche dédié "hotel" https://www.kayak.fr/ qui permet aussi de réserver des visites et des activités touristiques, avec des partenaires spécialisés comme https://www.viatorcom.fr/.

6/Faire le tour du marché en dressant la liste des grosses entreprises:
Filiale à 100% de TUI Group, TUI France regroupe les marques Nouvelles Frontières, Marmara, Passion des îles et Aventuria, ainsi que la compagnie aérienne Corsair International. TUI France est aujourd’hui leader sur le marché touristique français, avec une part de marché de 28% pour le tour operating et une forte expertise sur l’ensemble des métiers de la profession. Riche d’un patrimoine de marques, qui constitue un capital de valeur unique en France, TUI France offre un large panel de produits, adapté à chaque segment de clientèle : hôtel club, circuits, à la carte, ou encore sur mesure.

TUI Group est le leader mondial de l’industrie du tourisme. TUI Group couvre toute la chaîne de valeur du tourisme et emploie 76,000 personnes dans plus de 100 pays. Fort de cette expertise, nous proposons à nos clients plus de 20 millions des services autour de 180 destinations dans le monde entier.

Le domaine "tourisme" est très large mais il est compartimenté:
Les entreprises des secteurs du tourisme en 2013 (poids dans l’économie (7,3 % du PIB)):
 Domaine                  Nbr entreprises                              Employés (equiv temps plain) en milliers
 Hébergements          45 263                                           164,9
 Restauration           162 498                                           433,3
 Débits de boissons   42 232                                             36,9
 Transports                  5 410                                            244,4
 Agences de voyages  8 122                                              34,2
Ref: http://www.entreprises.gouv.fr/files/files/directions_services/etudes-et-statistiques/stats-tourisme/chiffres-cles/2015-Chiffres-cles-tourisme-FR.pdf

On peut donc remarquer que si on cible seulement les agences de voyage, le nbr d'entreprise reste limité.
L'hébergement de tourisme cible plus souvent les formations "hôtellerie".

Recherche d'un emploi par les moteurs des sites spécialisés

Les moteurs d'offre d'emploi généralistes:

En France étrangement les gros sites de petites annonces augmentent leur présence.
Le site www.leboncoin.fr a rapidement pris une place non négligeable.
ainsi que http://www.vivastreet.com.

Les autres sites français:
https://www.apec.fr/
pour premier job: https://jd.apec.fr/home.html
http://www.regionsjob.com/
https://www.keljob.com/
http://www.meteojob.com/


Indeed est un métamoteur de recherche d'emploi international disponible dans plus de 50 pays.
http://www.indeed.fr/
D'autres métamoteur ou aggrégateur important:
http://www.monster.fr/

Personnellement je préfère :
https://www.adzuna.fr/

Les réseaux avec les célèbres linkedin ou viadeo sont devenus des moteurs d'offre.

Les moteurs d'offre d'emploi non-généralistes:

par exemple, spécialisé dans tourisme et culture:



Les agences de placement de stage:

Il en existe deux types les gratuites et les sociétés qui profitent des étudiants pour gagner de l'argent en assurant un "service". Mais souvent ce service est très faible pour le montant demandé.
Exemples:

-dans les pays anglo-saxons, vu la forte demande des étudiants pour la pratique de l'anglais, il existe de très nombreuses sociétés.
http://www.internshipmakers.com/fr/

plutôt que payer 600euros pour ce genre de service. Faites un stage en France et payez vous un voyage avec 600euros dans le pays où vous vous voulez améliorer votre langue. 

Encuentroo est une agence qui recherche et propose des stages aux étudiants dans différents domaines. Soumettez votre candidature gratuitement, et ne payez votre inscription qu’au moment de la validation du stage par vous et l’entreprise (280€ + 40€ de frais de dossier). 
Nous assurons le suivi pendant le stage "gratuitement" et sommes disponibles sur place durant tout votre séjour en cas de problèmes. Nous proposons également des solutions de logement dans la ville de votre stage, le pick-up à l’aéroport, le transfert jusqu’à votre logement, la traduction du CV en espagnol…
Cours d’espagnol gratuit (3h/semaine) hors juillet/Août
Visite gratuite de la Ville de Morelia, de ses centres d’intérêts touristiques principaux et découverte de la gastronomie locale suivie d’une dégustation offerte.


qq témoignages:
http://laruche.wizbii.com/stage-etranger-eviter-arnaques/

Recherche d'un stage

quelques posts sur ce sujet:
http://www.webcairn.com/7-meilleurs-sites-pour-trouver-un-stage/
qui date de 08/2015


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PS

La clé du succès de Jobberman (site d'emploi en Afrique)? « Nous avons commencé longtemps avant que d’autres entrepreneurs pensent à créer un site d’emploi », explique Opeyemi Awoyemi. En outre, Jobberman ne se contente pas de faire le lien entre demandeurs d’emploi et employeurs : 
« En six ans, nous avons constaté que, 
derrière le problème du chômage, il y avait un problème de non-employabilité. 
Ça a clairement influencé notre mission. Nous tentons des partenariats avec des organisations gouvernementales et philanthropiques afin de créer des centres de conseils de carrière dans les villes et les universités du Nigeria. »


Tuesday, September 20, 2016

Some online text corpora and interfaces: BYU corpora and others.


Brigham Young University (BYU) corpora.

Example: Wikipedia
This corpus contains the full text of Wikipedia (2014), and it contains 1.9 billion words in more than 4.4 million articles.
http://corpus.byu.edu/wiki/


List of BYU corpora:

The most widely used online corpora -- more than 130,000 distinct researchers, teachers, and students each month.
English
# wordslanguage/dialecttime period compare
NOW Corpus   NEW 2.8 billion+20 countries / Web2010-yesterday
Global Web-Based English (GloWbE)1.9 billion20 countries / Web2012-13
Wikipedia Corpus1.9 billionEnglish-2014Info
Hansard Corpus (British Parliament)1.6 billionBritish1803-2005Info
Corpus of Contemporary American English (COCA)520 millionAmerican1990-2015* * * * *
Corpus of Historical American English (COHA)400 millionAmerican1810-2009* *
TIME Magazine Corpus100 millionAmerican1923-2006
Corpus of American Soap Operas100 millionAmerican2001-2012*
British National Corpus (BYU-BNC)*100 millionBritish1980s-1993* *
Strathy Corpus (Canada)50 millionCanadian1970s-2000s
CORE Corpus  NEW 50 millionWeb registers-2014
Other languages
Corpus del Español   (see also...)100 millionSpanish1200s-1900s*
Corpus do Português   (see also...)45 millionPortuguese1300s-1900s
N-grams
Google Books: American English155 billionAmerican1500s-2000s*
Google Books: British English34 billionBritish1500s-2000s
Google Books: One Million Books89 billionAm/Br1500s-2000s
Google Books: Spanish45 billionSpanish1500s-2000s


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https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_text_corpora




Corpus Google books

The most visible of all the available large corpora out there is from the Google Books project. There are several ways to interact with the data drawn from the several million books scanned by Google:
Google N-Grams Viewer:
http://books.google.com/ngrams/

This is the classic interface designed by Google which allows users to plot single words and short phrases over time in a large subset (~5 million books) of the corpus. In addition it provides searches in selected sets of curated works in the categories "American English," "British English," "English," "Chinese (simplified)," "English Fiction," "French," "German," "Hebrew," "Russian," and "Spanish."

Cultoromics Bookworm Viewer:
This is in many ways perhaps the best interface tool for queries in the Google Books corpus. Developed by the Culturomics folks at Harvard it limits itself to only those digitized texts which have information about them (Full title, Publication Date, Publication Place, etc.) on OpenLibrary.org. As a resuly users can run queries in highly selective corpora based on subject (books on world history, American books on science, etc.) though these corpora are much smaller than those in the full Google Books collection.

BYU Google Books Viewer:
This interface is the only of the above that allows users to search longer strings of words from the corpus. It also shows links to the books in which words appear by year (note however that this initiates a new search in Google Books which may not neccesarily match the original data used in graphing).. It  offers  the same corpora as available in N-Grams including American works (155 billion words) British works (34 billion words) Fiction (91 billion words) Spanish works (45 billion words), and a 1,000,000 book sample (89 billion words).

Five years after the article "Quantitative analysis of culture using millions of digitized books" in Science. End of culturomics?

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3279742/

Citing "articles" = 1000.
https://scholar.google.fr/scholar?hl=en&as_sdt=2005&sciodt=1,5&cites=6168981865649549013&scipsc=&q=&scisbd=1

Languages cool as they expand: 

Allometric scaling and the decreasing need for new words
Nature 2013.
http://physics.bu.edu/~amp17/webpage_files/MyPapers/AllometricScalingLanguage.pdf

We study language evolution by analyzing the word frequencies of millions of distinct words in seven languages recorded in books from the past two centuries. For all languages and time spans we confirm that two scaling regimes characterize the word frequency distributions, with the more common words in each language obeying the Zipf law. We measure the allometric scaling relation between corpus size and vocabulary size, confirming recent theoretical predictions that relate the Heaps law to the Zipf law. We measure a decreasing trend in the annual growth fluctuations of word use with increasing corpus size suggesting that the rate of linguistic evolution decreases as the language expands, implying that new words have increasing marginal returns, and that languages can be said to “cool by expansion.” Counteracting this cooling are periods of political conflict which are not only characterized by decreases in literary productivity but also by a globalized media focus which may increase the mobility of concepts and words across political borders.  

When physicists do linguistics

Is English ‘cooling’? A scientific paper gets the cold shoulder
http://www.bostonglobe.com/ideas/2013/02/10/when-physicists-linguistics/ZoHNxhE6uunmM7976nWsRP/story.html


PlosOne 2015:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26445406
Abstract:
It is tempting to treat frequency trends from the Google Books data sets as indicators of the "true" popularity of various words and phrases. Doing so allows us to draw quantitatively strong conclusions about the evolution of cultural perception of a given topic, such as time or gender. However, the Google Books corpus suffers from a number of limitations which make it an obscure mask of cultural popularity. A primary issue is that the corpus is in effect a library, containing one of each book. A single, prolific author is thereby able to noticeably insert new phrases into the Google Books lexicon, whether the author is widely read or not. With this understood, the Google Books corpus remains an important data set to be considered more lexicon-like than text-like. Here, we show that a distinct problematic feature arises from the inclusion of scientific texts, which have become an increasingly substantive portion of the corpus throughout the 1900 s. The result is a surge of phrases typical to academic articles but less common in general, such as references to time in the form of citations. We use information theoretic methods to highlight these dynamics by examining and comparing major contributions via a divergence measure of English data sets between decades in the period 1800-2000. We find that only the English Fiction data set from the second version of the corpus is not heavily affected by professional texts. Overall, our findings call into question the vast majority of existing claims drawn from the Google Books corpus, and point to the need to fully characterize the dynamics of the corpus before using these data sets to draw broad conclusions about cultural and linguistic evolution.

Plos comput biol 2016:
The Virtuous Cycle of a Data Ecosystem
http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1005037
Digital data of all types are being created at an ever-increasing rate, doubling approximately every two years.
Annual data creation rates are estimated to reach 44 trillion gigabytes by 2020.
Similarly, the rate at which primary scientific data are being collected is accelerating. This astounding growth in scientific data creation has led to the contemporary discussion of scientific data sharing policies. Many of the criticisms levied against data sharing have focused on practical issues such as the economics and logistics of data storage, technical challenges for doing so, or appropriate attribution of credit. In contrast, the arguments in favor of data sharing have focused largely on scientific replication, reproducibility, facilitation of collaborative research, and increased citations for publications that share data. This is largely an ethical argument wherein there is an obligation to share data collected using public funds.

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Monday, July 22, 2013

VNC Virtual Network Computing sur MAC (PPC 10.4; et 10.8)

VNC (Virtual Network Computing) est un logiciel/protocole de prise de contrôle d'un ordinateur à distance ou avec un petit ordinateur faire tourner des gros calculs sur une très grosse machine.
VNC fonctionne a partir d'une machine tournant sous le plupart des systèmes d'exploitation utilisés (Windows, Mac, Unix, Linux, Android ...) et permet de prendre le contrôle de machine tournant sous Mac, Unix, Windows...

Sous mac le meilleur est TurboVNC mais il ne fonctionne pas sous 10.4 et les vieux mac PPC...

Afin d'utiliser VNC, il faut des prérequis :
  •     la machine hôte doit avoir VNC Server d'installé,
  •     la machine cliente doit avoir VNC Viewer d'installé,
  •     les deux machines doivent pouvoir se joindre sur un réseau (local ou internet),
  •     les deux machines doivent avoir le port 5900 (par défaut ou celui choisi dans la configuration) d'ouvert
REF: http://www.technos-sources.com/tutorial-utilisation-configuration-vnc-22.aspx

A VNC system consists of a client, a server, and a communication protocol:
  •     The VNC server is the program on the machine that shares its screen. The server passively allows the client to take control of it.
  •     The VNC client (or viewer) is the program that watches, controls, and interacts with the server. The client controls the server.
  •     The VNC protocol (RFB) is very simple, based on one graphic primitive from server to client ("Put a rectangle of pixel data at the specified X,Y position") and event messages from client to server.

VNC se base sur le transfert d'images reproduisant le bureau distant, et l'envoi d'évènements (clic utilisateur sur pixel untel à reporter en action au serveur distant).
A ce titre, il doit envoyer des images complètes à chaque modification du bureau du serveur distant, ouverture de fenêtre d'application, etc...
Il n'existe pas de de notion de partage de session, une seule personne peut "prendre la main" sur le serveur à un instant t, et il laisse ses modifications en l'état sur la machine.

Il est par contre très apprécié car il permet d'intéragir comme si on était exactement devant le serveur.


Le choix de VNC viewer n'est pas simple:
http://fr.wikipedia.org/wiki/Virtual_Network_Computing

 Chicken of the VNC fonctionne mais il est limité.
TeamViewer 7 fonctionne sur des vieux mac (pas la version 8 de TeamViewer ≥10.5 macOSX) mais c'est de la réunion ou du contrôle par ID.
TurboVNC 1.2 et 1.1 demandent des MAC récents.
JollysFastVNC est intéressant...

Friday, July 12, 2013

logiciels pour le traitement des images IRM en neuro-imagerie; 3D

l'IRM a 30ans donc il existe une pléthore de techniques (issus de la zoologie des séquences de pulses).

Il existe bcp de logiciels de traitement des images IRM:

un des plus "complets" pour les domaines neuro-imagerie anat+fonctionnelle y compris l'animal:
FreeSurfer
http://fr.wikipedia.org/wiki/FreeSurfer
fonctionne sur Mac OS et Linux

Rem: Caret et 3D Slicer peuvent importer des données générées par FreeSurfer...

-Pour le télécharger:
https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall
-pour les débutants et wiki:
http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki
-pour un overview:
http://www.grahamwideman.com/gw/brain/fs/index.htm
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MRIcro:
http://www.mccauslandcenter.sc.edu/mricro/mricro/mricro.html
efficace
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osirix
http://www.osirix-viewer.com/Downloads.html
http://fr.wikipedia.org/wiki/OsiriX

Navigating the Fifth Dimension: Innovative Interface for Multidimensional Multimodality Image Navigation, 2006; doi: 10.1148/rg.261055066
http://radiographics.rsna.org/content/26/1/299.full

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medinria
http://med.inria.fr/

medInria is a multi-platform medical image processing and visualization software. It is free and open-source. Through an intuitive user interface, medInria offers from standard to cutting-edge processing functionalities for your medical images such as 2D/3D/4D image visualization
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brain visa/anatomist
http://brainvisa.info/index_f.html

BrainVISA est distribué avec une boîte à outils dédiée à la segmentation d'images IRM pondérées en T1. Le produit de la principale chaîne de traitements issue de cette boîte à outils est le suivant: une classification gris/blanc pour la morphométrie voxel par voxel, des maillages des surfaces de chaque hémiphère pour la visualisation, des maillages sphériques de la matière blanche de chaque hémisphère, un graphe des plissements corticaux, un étiquetage de ces plissements fondé sur une nomenclature des principaux sillons
You need about 1.5 Gb free disk space to install the BrainVISA pack 4.1. Yes, it's big, but it contains lots of useful things.
Here are the commands to uncompress the package:
On Linux and MacOS:
tar jxvf <brainvisa_package>.tar.bz2
On Windows: unzip the zip file using whatever unzip tool you like (windows XP has one builtin in the system).
The package consists of two main programs, anatomist and brainvisa, and a suite of utility programs. All are located in the 'bin' directory of the package. It may be dangerous in a few cases to permanently add this directory to your path, because this can create conflicts with other programs on your system (e.g. python). We suggest two possibilities.
To start a program, type the full path along with the name of the program, e.g.:

  ~/<brainvisa_package>/bin/anatomist
(or create symbolic links to 'anatomist' and 'brainvisa' in a directory listed in your path (maybe /home/yourlogin/bin)

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Afni
http://afni.nimh.nih.gov/afni/
Analysis of Functional NeuroImages
is a set of C programs for processing, analyzing, and displaying functional MRI (FMRI) data - a technique for mapping human brain activity. It runs on Unix+X11+Motif systems, including SGI, Solaris, Linux, and Mac OS X. It is available free (in C source code format, and some precompiled binaries) for research purposes.
Matlab Library
Ziad Saad and Gang Chen have developed a package of Matlab functions to read, write, and process AFNI datasets. This may be useful for those who want to carry out matlab-based computations such as Dr. Worsley's FMRISTAT or Gang Chen's 4-way ANOVA or user cuddly 3dDeconvolve.
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caret

http://brainvis.wustl.edu/wiki/index.php/Main_Page

Cortical Cartography

(March, 2012) Release of human 'Conte69 atlas' surface-based atlas See Details
Caret software for visualizing and analyzing experimental data on surfaces and volumes
The SumsDB database of published (freely available) and unpublished (private) neuroimaging data. Read more
Webcaret software for online visualization of SumsDB datasets.Read more
Atlases of human, macaque, mouse, and rat that facilitate cross-study comparisons and data mining
Neuroimaging foci. Published stereotaxic coordinates (‘foci’) are especially amenable to data mining. SumsDB currently provides free access to ~25,000 foci from ~800 studies along with tutorials. see also
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en plus de ces rendus surfacique, on peut avoir besoin de maillage.
qualité maillage, un excellent programme:
meshlab
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3D maillages:
import/export http://www.simpleware.com/software/

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-------ImageJ

pour voir les données et pour voir les prétraitements des images, j'aime bien
imageJ avec 3D viewer (plug-in)

Using the 3D viewer as an ImageJ plugin

The ImageJ 3D viewer provides a plugin for ImageJ to visualize image stacks three-dimensionally. The most important features include:

Display stacks as volume renderings, iso-surfaces, orthoslices or surface plots.
Volume editing.
Landmark selection.
Rigid registration, based on manually selected landmarks.
Displaying 4D data.

Using the 3D viewer as a programming library

The viewer can not only be used as an application, but can also be utilized from other Java programs, especially ImageJ plugins, as a library. It offers a well-documented API for high-level 3D visualization.

Displaying an image stack three-dimensional is a matter of a few lines of code:
// Open image
ImagePlus imp = IJ.openImage("/path/to/image");

// Create a universe and show it
Image3DUniverse univ = new Image3DUniverse();
univ.show();

// Add the image as an isosurface
Content c = univ.addVoltex(imp);
--
Point lists

How to create landmarks
How to show and hide landmark points.
How to save and load landmark points.
How to edit them.
Landmark-based registration

How to use landmark points for landmark-based rigid registration
Transformations

How to set and apply transformations in form of matrices
How to save and load transformation matrices
How to avoid unintended object transformation by locking it
How to reset the transformation of an object.
3D Content in PDFs

How to export triangle meshes to a .u3d file or STL file import/export
How to embed the u3d file in a latex file
How to compile it into a pdf containing the 3D data

http://3dviewer.neurofly.de/
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ajouter d'autres plug-in pour la segmentation de base:
Download IntSeg_3D.jar
http://3dviewer.neurofly.de/
part of his thesis
-----
Fiji's main purpose is to provide a distribution of ImageJ with many bundled plugins.
http://en.wikipedia.org/wiki/FIJI_(software)

http://fiji.sc/Fiji
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Wednesday, July 10, 2013

IRM pour les nuls, une introduction, trop longue...; un bloc-note de surf........


Voici le paragraphe de présentation dans  wikipedia:

L'imagerie par résonance magnétique (IRM) est une technique d'imagerie médicale permettant d'obtenir des vues 2D ou 3D de l'intérieur du corps de façon non invasive avec une résolution en contraste1 relativement élevée.

L'IRM repose sur le principe de la résonance magnétique nucléaire (RMN) qui utilise les propriétés quantiques des noyaux atomiques pour la spectroscopie en analyse chimique.

L'IRM nécessite un champ magnétique puissant et stable produit par un aimant supraconducteur qui crée une magnétisation des tissus par alignement des moments magnétiques de spin.

Des champs magnétiques oscillants plus faibles, dits radiofréquence, sont alors appliqués de façon à légèrement modifier cet alignement et produire un phénomène de précession qui donne lieu à un signal électromagnétique mesurable.
La spécificité de l'IRM consiste à localiser précisément dans l'espace l'origine de ce signal RMN en appliquant des champs magnétiques non uniformes, des « gradients », qui vont induire des fréquences de précession légèrement différentes en fonction de la position des atomes dans ces gradients.

Sur ce principe qui a valu à ses inventeurs, Paul Lauterbur et Peter Mansfield le Prix Nobel de physiologie ou médecine en 2003, il est alors possible de reconstruire une image en deux dimensions puis en trois dimensions de la composition chimique et donc de la nature des tissus biologiques explorés.

Ouf!

on peut voir aussi:
http://www.lerepairedessciences.fr/sciences/agregation_fichiers/CHIMIE/rmn/magnetique.htm

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le mot "magnétisme", si mystérieux, a fait oublié le mot important "résonance", mais le mot  important est aussi "proton" (ou matière nucléaire ou fermion). Ces fermions sont AIMANTES par l'énorme champ (dit statique) et seront perturbés par des ondes électromagnétiques (des bosons) permettant la localisation et donc l'imagerie.
Il faut commencer par entendre ces mots cela dès le début même si on est perdu dès le début.
Mais ce vocabulaire n'est pas suffisant. 
En final le mot le plus important correspond à un phénomène qui n'apparait pas dans les noms RMN et IRM: l'aimantation.
Le proton (et les nucléons impairs) n'est pas ici un aimant-comme-en-ferromagnétisme, 
(les aimants de la vie de tous les jours, qui correspondent à la propriété qu'ont certains corps/particules de s'aimanter très fortement sous l'effet d'un champ magnétique extérieur, et pour certains (les aimants; structure avec domaine de Weiss) de garder une aimantation importante même après la disparition du champ extérieur).

Du fait que cette aimantation est ridiculement faible (et malgré la résonance), le problème central est l'instrumentation avec la recherche du rapport signal/bruit.  
Un IRM est un classe d'appareil de mesure qui a besoin de matière c-a-d que le détecteur (on dit antenne en IRM) doit toujours être proche d'un milieu dense (détecteur et milieu sont à une distance inférieur à la longueur d'onde); on dit que l'on est en "champs proche".

Si on calcul alors on obtient seulement 1 proton pour un million mais la résultante est orientée ce qui fait qu'on a un aimant "macroscopique/mésoscopique"... On voit le liquide cephalorachidien avec un fort signal dans ce cas.
En mathématique cette résultante est spéciale on parle de précession:
http://fr.wikipedia.org/wiki/Pr%C3%A9cession
http://en.wikipedia.org/wiki/Precession

La précession implique de nombreux outils mathématiques. En physique il existe de nombreux phénomènes qui conduisent à des précessions.
http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/top.html
Bref, on a maintenant un milieu aimanté dans une direction donnée (et qui précesse à vitesse angulaire constante : 400millionCycle/seconde à 9.4teslas).
Cette aimantation est une oscillation strictement périodique dans le temps dès qu'elle est dans le champ à 9.4teslas.
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La perturbation de cette aimantation est une oscillation pseudo-périodique dans le temps.  Si on choisit le proton comme cible il existe une fréquence de résonance. Le point important est que cette fréquence EST PROPOTIONNELLE au champ appliqué:
9.4teslas=400MHz
0.94teslas=40MHz...
On réalisant des gradients on va un peu changer celles ci.
Cette "lumière" autour de 400millionCycle/seconde se situe dans la fenêtre spectrale des radio-fréquences.
Une oscillation  électromagnétique (onde lumineuse qui suit souvent l'opérateur d'alembertien en champ lointain ou les équations dite de Maxwell en champ proche)

pour les plus courageux:
http://prl.aps.org/abstract/PRL/v74/i4/p526_1
Generalized Field Propagator for Electromagnetic Scattering and Light Confinement
Olivier J. F. Martin,Christian Girard,Alain Dereux, PRL 1995.

 EN champ lointain, solution exacte  e^(i2πt/T) avec T période temporelle; le Hertz est un nombre de cycle_E-B/s et est trop souvent réduit à l'inverse d'une seconde:
  -400MHz=400 millions de cycleE-B/s
  -la période temporelle du cycle_E-B est ici de : T=2.5ns/(cycle_E-B). 

Les plus gros IRM tendent vers le 1GHz (celui de Floride : 900MHz) soit 1ns. 
Le record chez l'animal in vivo serait en Floride 
http://www.magnet.fsu.edu/mediacenter/slideshows/strongestmri/index.html
900MHz (21.1 teslas).

Vitesse des ondes electromagnétiques =0.3m/ns 
donc  à 400MHz la longueur d'onde  (nommée lambda) est de 7.5cm.
et lambda/2π=2cm.

Sur le Varian-Agilent 9.4Teslas, les bobines de gradient (38Kg; SG RAD 156/100/HD/S) sont à 2mT/m/A donc avec 100A (max 200A, 300V et quelques dizaines de ms  (max 50ms)),
on a donc 2mT/cm/(100A)
Sur 2cm le champ de perturbation reste de 4mT donc assez faible mais il est en résonance et va faire une induire une autre direction de précession. à 400MHz, 1ms correspond à 400 000 oscillations en résonance comme une balancoire.

ON A FINI avec les BOSONS (et le champ magnétique statique).
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On commence par la matière: le noyau le plus "simple"= le proton.
http://fr.wikipedia.org/wiki/Proton

Toutes les applications RMN, IRM... sont liées aux propriétés magnétiques des noyaux atomiques impairs. La physique classique, celle de Newton et de Maxwell, est incapable de rendre compte de ces propriétés.

L'expérience de résonance magnétique est fondée sur la MESURE de l'AIMANTATION d'un système MACROSCOPIQUE contenant N spins où N est d'un ordre de grandeur comparable au nombre d'Avogadro: NA = 6,02214129(27) × 1023 mol−1
Quelques grammes comportent 10^23 noyaux!

La description quantique d'un seul spin I "isolé" se fait via une fonction d'onde dans une espace de dimension 2I+1 (si I=1/2 alors dimension 2). La description des N spins correspond à un espace de dimension (2I+1)^N.

En outre on néglige les interactions noyau-électrons. La polarisation des couches électroniques par le champ magnétique statique ainsi que la précession propre des électrons induisent à l'emplacement du noyau, un petit champ supplémentaire inhomogène. La fréquence de résonance est déplacée d'une petite quantité que l'on applelle le déplacement chimique car lié à l'environnement des électrons. Et ainsi de suite avec les intéractions à plus grande portée qui permettent de trouver des grosses molécules repliées.

Dans le vivant et la matière commune l'atome le plus simple c'est l'hydrogène.
Dans la croûte terrestre, l'hydrogène ne représente que 0.22 % des atomes, loin derrière l'oxygène (47 %) et le silicium (27 %) [hydrogène-wikipedia].
L'hydrogène représente 63 % des atomes du corps humain.
Le vivant fonctionne au proton (théorie de Mitchell; mitochondrie...) et est très lié à l'eau H2O qui elle-même est un milieu très complexe même en solution liquide à pression/température ordinaire, où il compte 2atomes sur 3 mais en gramme il est petit en %.

Un noyau atomique a des propriétés et il est pensé comme constitué de protons et de neutrons, à l’exception de ce noyau de l’atome d’hydrogène, constitué d’un unique proton. Un noyau posséde une masse, une charge électrique, un moment cinétique, un volume... Après les champs et autres concepts, on les construits à partir des données macroscopiques du XIXième de Faraday. ce sont des correspondances à la Baudelaire. Le noyau existe des charges bougent mais ces grandeurs sont des "concepts" qui conduisent à des "quantities" mesurables.
La méthode de Galilé est que l'on va restreindre cet être atomique à un nombre limité de grandeur suffisant pour le problème considéré.
On note L→ le moment cinétique (flèche notation vecteur, au dessus normalement).
Le moment magnétique est symbolisé en M→.
Ces 2 grandeurs physiques "caractérisent" un mouvement de rotation propre sur elle-mêmes. Les noyaux tournent sur eux-mêmes ou « spinnent » (de l’anglais : to spin).
Une "sphère-nucléonique" pseudo-homogène tournant sur elle-même possède des propriétés quantiques et l'on passe à des visions classiques homogèneisées par exemple un moment cinétique propre, grandeur vectorielle dont les caractéristiques sont :
– sa direction, identique à celle de l’axe de rotation,
– son sens, défini de façon conventionnelle par le sens de déplacement d’un tire-bouchon ordinaire
                  qui serait solidaire de la sphère.,
– sa norme, proportionnelle à la fréquence de rotation.

MAGNETISME NUCLEAIRE

Magnétisme nucléaire pour les dummies

Pour les hyperDummies, une particule chargée qui tourne sur elle-même induit un MOMENT MAGNÉTIQUE (équivalent à un champ magnétique de très faible intensité).
Ce moment magnétique est représenté par un vecteur d’aimantation.
http://irm-francophone.info/htm/mag_nuc.htm

Un proton dans un champ magnétique peut être considéré comme un petit dipôle caractérisé par un vecteur d'aimantation  µo (représentant le moment bipolaire). le pb multi-échelle: pour un ensemble de protons, c-a-d pour un tissu donné on parle de vecteur d'aimantation macroscopique Mo tels que:
  Mo =Σµo
(le vecteur Mo est égal à la somme de tous les petits vecteurs µo).
Le pb est réduit d'une société à une simple somme d'individu.

Les protons , de même que les neutrons, ont un vecteur d’aimantation non nul (lié à la disposition des quarks). Dans le noyau, les nucléons (un peu à l’image des électrons autour du noyau) sont répartis en couches, de manière à ce que les neutrons d’une part, et les protons de l’autre, s’apparient deux à deux. Cette association en duo annule ainsi leurs moments magnétiques afin de maintenir une cohésion énergétique au sein du noyau. Donc, au final, nous pouvons déduire que seuls les atomes à nombre de nucléons IMPAIRES auront un moment magnétique effectif ou intrinsèque ou élémentaire.
Il existe plusieurs atomes ayant cette capacité, mais seulement quelques uns ont un intérêt biologique.

Le noyau d’hydrogène n’est composé que d’un seul proton. On peut en conclure d’ores et déjà, que cet atome dispose d’un moment magnétique élémentaire protonique élevé et il donne lieu à un phénomène de résonance très net.
 
Conclusion : nous pouvons donc assimiler le Proton (ou atome d’hydrogène) à un petit aimant microscopique comme première approche?

Magnétisme nucléaire proche de la réalité macroscopique?



est une vision fausse...


La mécanique classique n'impoe pas à L→ à posséder des valeurs particulières ni pour
sa norme L ni pour la valeur algébrique L(u→) qui est sa projection sur un axe quelconque de
vecteur directeur u→.
On constate que la réalité nous initie à des choses "bizarres": le moment cinétique des noyaux atomiques, au contraire, possède une norme qui ne dépend que de la nature du noyau considéré et L(u→) ne peut prendre qu’un nombre limité de valeurs. "C'est une toupie à engrenage qui s'inverse donc pas une toupie".
La valeur de L se calcule à partir d’un nombre entier ou demi-entier I appelé nombre de spin (ou spin). Les valeurs possibles de L(u→)  se déduisent du nombre mI vérifiant:

L(u→)  = mI  ℏ

http://fr.wikipedia.org/wiki/Constante_de_Planck_r%C3%A9duite

Avant d'en venir à la résonance, il faut comprendre que cette CONSTANTE intervient aussi pour les échanges d'énergie et le temps:
This relation between the energy and frequency is called the Planck relation:
E = h\nu \,.
Since the frequency \nu, wavelength λ, and speed of light c are related by λν = c, the Planck relation for a photon can also be expressed as
E = \frac{hc}{\lambda}.\,
The above equation leads to another relationship involving the Planck constant. Given p for the linear momentum of a particle, the de Broglie wavelength λ of the particle is given by
\lambda = \frac{h}{p}.
In applications where frequency is expressed in terms of radians per second ("angular frequency") instead of cycles per second, it is often useful to absorb a factor of 2π into the Planck constant. The resulting constant is called the reduced Planck constant or Dirac constant. It is equal to the Planck constant divided by 2π, and is denoted ħ ("h-bar"):
\hbar = \frac{h}{2 \pi}.
The energy of a photon with angular frequency ω, where ω = 2πν, is given by
E = \hbar \omega.
The reduced Planck constant is the quantum of angular momentum in quantum mechanics.
C'est LA RELATION entre une énergie d'interaction électromagnétique et le moment angulaire avec les bonnes grandeurs.
Il est très connu que la solution exacte de l'opérateur D'Alembertien (champ lointain): 
E e-i2πt/T  (w=pulsation=2π/T et T période).
h_barre est une {joule*temps} comme grandeur. 


La rotation interne des noyaux atomiques n’est pas mise en évidence de façon directe mais
elle est pensée comme la cause de leur moment magnétique M→, grandeur vectorielle dont l’existence
est révélée par l’interaction du noyau avec un champ magnétique, comme indiqué ci-après. 

---------------Remarque

La résonance

Définition : la RÉSONANCE est le transfert d’énergie entre deux systèmes oscillant à la même fréquence

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Modélisation par équations de Bloch:

Le meilleur site pour l'éducation MRI et ces équations serait:
 http://drcmr.dk/Education
http://drcmr.dk/bloch

----------------contrastes
http://irm-francophone.info/htm/contrast.htm

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Deux champs vectoriels apparentés portent le nom de champ magnétique, et sont notés  B (qui s'exprime en tesla) et H (qui s'exprime en ampère par mètre). Si les normes internationales de terminologie prescrivent de réserver normalement l’appellation de « champ magnétique » ou d'« intensité de champ magnétique » au seul champ vectoriel .

On peut remarquer d'abord que ces deux champs s'expriment dans des unités différentes :
• B s'exprime en tesla (T) ;
• H s'exprime en ampères par mètre (A/m), tout comme M.
Cette différence traduit le fait que B est défini par ses effets (force de Laplace) alors que H est défini par la façon de le créer avec des courants (∇×H = j).
Dans le vide, on a M = 0, et donc :
B=µ0 H

On peut alors interpréter la multiplication par μ0 comme un simple changement d'unités et considérer que les deux champs sont identiques. L'ambigüité qui découle du fait que l'un comme l'autre peut être appelé champ magnétique est alors sans conséquence. En pratique, beaucoup de matériaux, dont l'air, sont très faiblement magnétiques (M ≪ H) et l'équation ci-dessus reste une très bonne approximation.
Cependant, dans les matériaux ferromagnétiques, notamment les aimants, l'aimantation ne peut être négligée. Il est important alors de distinguer les champs B et H à l'intérieur du matériau, bien qu'ils restent identiques à l'extérieur. Dans le cas d'un aimant barreau par exemple, les deux champs sont globalement orientés du pôle nord vers le pôle sud à l'extérieur de l'aimant. Cependant, à l'intérieur de celui-ci le champ H est globalement orienté du nord vers le sud (opposé à M, d'où le nom de champ démagnétisant) alors que B va du sud vers le nord.
On peut remarquer que les lignes du champ B se bouclent sur elles-mêmes, ce qui est une conséquence de ∇⋅B = 0, alors que les lignes de H ont toutes comme point de départ le pôle nord et comme point d'arrivée le pôle sud.
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Rem:
Cette lettre "B", empruntée à James Clerk Maxwell, vient de ses notations : il décrivait les trois composantes du champ magnétique indépendamment, par les lettres B, C, D. Les composantes du champ électrique étant, dans les notations de Maxwell les lettres E, F, G.

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Les différentes sources de champ magnétique sont les  le courant électrique (c'est-à-dire le déplacement d'ensemble de charges électriques), ainsi que la variation temporelle d'un champ électrique (induction magnétique) et les aimants permanents. 
La présence du champ magnétique se traduit par l'existence d'une force agissant sur les charges électriques en mouvement (dite force de Lorentz) et par divers effets affectant certains matériaux (paramagnétisme, diamagnétisme ou ferromagnétisme selon les cas). 
La grandeur qui détermine l'interaction entre un matériau et un champ magnétique est la susceptibilité magnétique.
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En physique classique, les champs magnétiques sont issus de courants électriques. Au niveau microscopique, un électron en « orbite » autour d'un noyau atomique peut être vu comme une minuscule boucle de courant, générant un faible champ magnétique et se comportant comme un dipôle magnétique. Selon les propriétés des matériaux, ces structures magnétiques microscopiques vont donner lieu à essentiellement trois types de phénomènes :
• Dans certains cas, les champs produits par des électrons d'atomes voisins présentent une certaine tendance à s'aligner les uns par rapport aux autres, un champ magnétique macroscopique, c'est-à-dire une aimantation spontanée, est susceptible d'apparaître. C'est le phénomène de ferromagnétisme, expliquant l'existence d'aimants permanents. Il est possible de détruire le champ magnétique d'un aimant en le chauffant au-delà d'une certaine température. L'agitation thermique générée par le chauffage brise les interactions entre atomes proches qui étaient responsables de l'alignement des champs magnétiques atomiques. En pratique, le phénomène de ferromagnétisme disparaît au-delà d'une certaine température appelée température de Curie. Elle est de 770 °C pour le fer.
• En l'absence de ferromagnétisme, ou à une température trop élevée pour que celui-ci apparaisse, la présence d'un champ magnétique externe peut amener les champs microscopiques à s'aligner dans le sens du champ. Ce phénomène est appelé paramagnétisme. La transition entre l'état ferromagnétique et l'état paramagnétique se fait par l'intermédiaire d'une transition de phase dite de second ordre (c'est-à-dire que l'aimantation tend continûment vers 0 à mesure que la température approche la température de Curie, mais que sa dérivée par rapport à la température diverge à la transition). Le premier modèle mathématique permettant de reproduire un tel comportement s'appelle le modèle d'Ising, dont la résolution, considérée comme un tour de force mathématique, a été effectuée par le prix Nobel de chimie Lars Onsager en 1944.
• À l'inverse, certains matériaux tendent à réagir en alignant leurs champs magnétiques microscopiques de façon antiparallèle avec le champ, c'est-à-dire s'efforçant de diminuer le champ magnétique imposé de l'extérieur. Un tel phénomène est appelé diamagnétisme.

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sous 9.4teslas; la matière change. comment?
on a pas des protons mais de l'eau , eau libre et eau liée.

La susceptibilité magnétique (notée Chim) est la faculté d'un matériau à s'aimanter sous l'action d'une excitation magnétique.
La réaction est de deux types :
-aimantation du matériau
-s'accompagnant de l'apparition d'une force mécanique.

Caractérisation macroscopique
L'aimantation est proportionnelle à l'excitation magnétique appliquée : le coefficient de proportionnalité, noté , définit la susceptibilité magnétique du milieu ou matériau considéré.

M=Chim H

avec  M l'aimantation en ampère par mètre (A/m), Chim la susceptibilité magnétique (sans dimension) et H l'excitation magnétique appliquée aussi en ampère par mètre (A/m).
• Lorsque  est positif, on dit que le corps dans lequel apparaît l'aimantation est paramagnétique.
• Lorsque  est nul, on a du vide.
• Lorsque  est négatif, le corps est dit diamagnétique.


À cette catégorisation se superpose une seconde classification, avec notamment le ferromagnétisme (qui caractérise les corps qui conservent leur aimantation en l'absence d'excitation, tels que le fer, le cobalt ou le nickel; paramagnétisme très intense et rémanent).

pour l'eau :   Chim= -1.2 10^-5, (le fer à 774°C   =200).

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magnétique macroscopique mesurable (Figure 1). Un dipôle magnétique placé dans un champ magnétique B s’oriente sous l’action du champ (cas de la boussole). En présence d’un champ magnétique statique B0, les moments magnétiques de spin des protons vont s’orienter selon 2 directions correspondant à 2 niveaux d’énergie (et vont être animés d'un mouvement de précession). Ils s’orientent de manière parallèle au champ (dans le même sens, niveau d'énergie le plus stable), ou de manière antiparallèle (dans le sens opposé, niveau d'énergie le moins stable).

La population de moments magnétiques de spin orientés parallèlement (sur le niveau d’énergie le plus stable) étant légèrement en plus grand nombre, on obtient une résultante M0 (somme de tous les moments magnétiques) non nul et dans le sens de B0. 

ON A UNE AIMANTATION MACROSCOPIQUE mais très faible!
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